当前解析结果
SmilChr03G002625| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002625 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002625 |
| 描述 | cytochrome c oxidase-assembly factor COX23, mitochondrial |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 41651615 - 41653296 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016779 |
|---|---|
| GeneID | 131016779 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016779 |
| 原始查询 | LOC131016779 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome c oxidase-assembly factor COX23, mitochondrial |
| 产物 | cytochrome c oxidase-assembly factor COX23%2C mitochondrial |
| Arabidopsis | AT1G02160 (AT1G02160)Cox19 family protein (CHCH motif) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839554] identity=72.9; qcov=0.972; evalue=5.54e-28; confidence=medium |
| Rice | Os04g0665000- identity=73.7; qcov=0.792; evalue=1.53e-24; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06747 (CHCH) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016779 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057801486.1 |
| 2 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 1.00000 | XP_057801486.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057801486.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801486.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801486.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057801486.1PF06747
CHCH 27-56 aa
XP_057801487.1PF06747
CHCH 27-56 aa
XP_057801488.1PF06747
CHCH 27-56 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057801486.1 |
Pfam | PF06747 |
CHCH | Domain | 27 | 56 | 3.3e-07 | 31.0 | CHCH domain |
XP_057801487.1 |
Pfam | PF06747 |
CHCH | Domain | 27 | 56 | 2.4e-07 | 31.4 | CHCH domain |
XP_057801488.1 |
Pfam | PF06747 |
CHCH | Domain | 27 | 56 | 2.4e-07 | 31.4 | CHCH domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。