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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000044`

染色体: Chr03 坐标: 487964-491580 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000044`
名称	SmilChr03G000044
描述	uncharacterized SmilChr03G000044
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	487964 - 491580 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016805`
GeneID	`131016805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016805`
原始查询	`LOC131016805`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.8; qcov=0.715; evalue=6.83e-61; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=34.7; qcov=0.689; evalue=2.33e-111; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801530.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801530.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801530.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801530.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:488140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:488166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B32,C53,D7
`Chr3:488169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B120,C33,C36
`Chr3:488183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B20,D11
`Chr3:488207`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A2,B69,C22,C77
`Chr3:488207`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A2,B69,C22,C77
`Chr3:488238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:488269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:488275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B32,C53,D7
`Chr3:488314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C48
`Chr3:488315`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A11,B80,B82,B98,C15,C56,C79
`Chr3:488319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801530.1

912 aa

456

912

DBD_Tnp_Mut

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 210-266 aa PF10551 MULE 408-503 aa PF00872 Transposase_mut 425-507 aa PF04434 SWIM 656-684 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801530.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	210	266	2.7e-06	27.7	MuDR family transposase
`XP_057801530.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	408	503	2.4e-16	60.6	MULE transposase domain
`XP_057801530.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	425	507	1.8e-05	24.6	Transposase, Mutator family
`XP_057801530.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	656	684	5.2e-10	39.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945547.1
CTTAAGTGGGAGCCCTTAGAGCGTTTTACTCCCCATACTAACTGTGTGTGCAATTTAACCCCTAAACTACCAAAAATCACACATTTAAGCCCCCACGACCAAACGCCGTTAGTCAACGTCCGATTTTTTTTGCGCGGGTTTTCTCACCCCACTTTCAGTCCAACAGTCTCTCAAGTAAATGAATCCTCCCATCAAACATCCTCAAAATTTTATGAATTAATCGGCAACTCGAAGAAGAAGAGGGTTTCTGGGAAGAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016805
ATGTGCAGTATGGCGCCTCCTGTTCTTTTTATTTTCAACTTTTGGGGTGTATGGAAAAAAGATGAAGATTCTGGTGATTTGATTCATGATGGTTATAATTCTGTTGAGCTTGAGGATAGTGCTAAAAATATGACTTTTGATCGGATTAATGATGAATATGAGAAGATTTATGGGAGTAAACCTAGTAAAGTTTATGCGTGTGATGAGGATTATAAGGTAGAGAATGGCCTAGTTCACCTTAGGGATTCAAAACATTGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801530.1
MCSMAPPVLFIFNFWGVWKKDEDSGDLIHDGYNSVELEDSAKNMTFDRINDEYEKIYGSKPSKVYACDEDYKVENGLVHLRDSKHCHKVLDYFELVNQEQVHFFADHDRDPMPSITPLALFPDDSADDNLDGEGAEPTSGGEHNDGEDLGNVTGVEGAEEAEGEQEAEGELDEGDSDDSSVFSQESSESEEENNIQMIGSVEDGQEGSFSLGMTFADAKDAKDAIHAYGVKFGYKLKFLKNEPKRIRVVCMNEVSCPFVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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