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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001297`

染色体: Chr01 坐标: 25838275-25844640 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001297`
名称	SmilChr01G001297
描述	T-complex protein 1 subunit gamma
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25838275 - 25844640 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016809`
GeneID	`131016809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016809`
原始查询	`LOC131016809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	T-complex protein 1 subunit gamma
产物	T-complex protein 1 subunit gamma
Arabidopsis	`AT5G26360` (AT5G26360) TCP-1/cpn60 chaperonin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832705] identity=89.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0538000` - identity=88.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005832 (chaperonin-containing T-complex); GO:0006457 (protein folding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801538.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801538.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057801538.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057801538.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057801538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25839105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,D2
`Chr1:25839668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B127,B89,B99,C1
`Chr1:25839924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:25842376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:25842919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:25842942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B99,C2
`Chr1:25843709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:25844148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801538.1

556 aa

278

556

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 31-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801538.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	31	524	3.2e-160	534.8	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945555.1
ATTTTATTTTTATATCTTGATCGGCGCCGCTTCTTTCACTTCTCCCTTCTTCGCATTTCTTCTTCTTCTTTCTTCACTCTGTATTATTTTTCCTTCTTTTTGTACCCTTGTTCAACATCCAGGGTTTTCCAAGAAGCGCCTTTTGCCTTCATTTGATTCCTCTGCGTCGATCTTCACTCTTCTCTTGCTGATCTTGCAATTTCAAATCGAAAGTCGAGATGCATGCGCCAGTCCTCGTCCTCAAAGATACGGTGAAGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016809
ATGCATGCGCCAGTCCTCGTCCTCAAAGATACGGTGAAGCGTGAATCTGGAAGCAAGGTTCACCATGCTAATATCCAAGCATCCAAGGCTGTTGCCGATATTATTCGTACTACTTTGGGTCCACGGTCAATGTTGAAAATGCTGCTTGATGCGGCTGGAGGGATTGTAGTGACAAATGATGGAAATGCTATTCTTCGTGAATTAGATGTGGCACACCCAGCAGCAAAGTCAATGATTGAGCTAAGCCGAACCCAGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801538.1
MHAPVLVLKDTVKRESGSKVHHANIQASKAVADIIRTTLGPRSMLKMLLDAAGGIVVTNDGNAILRELDVAHPAAKSMIELSRTQDEEVGDGTTSVIVLAGEMLHVAEAFIDKNYHPTIICRAYNKALEDAITVLDKIAMTIDVKDRATMLGLVKSCIGTKFTSQFGDLIADLAIDATTTVGVELGQGLREVDIKKYIKVEKVPGGQLEDSKVLKGVMINKDVVAPGKMRRKIVNPRIILLDSPLEYKKGENQTNAELMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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