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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000163`

染色体: Chr03 坐标: 1796773-1808516 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000163`
名称	SmilChr03G000163
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1796773 - 1808516 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016829`
GeneID	`131016829`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016829`
原始查询	`LOC131016829`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-23
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=27.4; qcov=0.843; evalue=1.79e-60; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=29.7; qcov=0.841; evalue=5.49e-75; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016829

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801573.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057801573.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057801573.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801573.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801573.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1796833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1796881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1796887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1796964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1796994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1797013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1797034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1797038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:1797039`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B17
`Chr3:1797039`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B17
`Chr3:1797183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B16,C15,C37,D9
`Chr3:1798043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801573.1

861 aa

430

861

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 143-313 aa PF23559 WHD_DRP 389-460 aa PF23598 LRR_14 515-828 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801573.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	143	313	2.7e-40	138.5	NB-ARC domain
`XP_057801573.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	389	460	3e-19	69.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801573.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	515	828	4.5e-17	62.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945590.1
AATAATTTTGAGAACTCTTCTTCTTTGTGTAGAATCGAGATGGCTTATGAAGCTCTTGATGACCTGCAACAAATCTTAGATCAAATCCTAGAACACCGTTATGATATCCTCACTCATTCTATAAAACAAGAAATTATATCCATCCGCGACCATTCTATTGTGTTGCAATGGAATCTCAAACATTATCCAAACAAACAAAGAATCAGAGAGGCAGCAAGTTCGACACATGAGATTATTGAACATCTCTTCTCTGAAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016829
ATGGCTTATGAAGCTCTTGATGACCTGCAACAAATCTTAGATCAAATCCTAGAACACCGTTATGATATCCTCACTCATTCTATAAAACAAGAAATTATATCCATCCGCGACCATTCTATTGTGTTGCAATGGAATCTCAAACATTATCCAAACAAACAAAGAATCAGAGAGGCAGCAAGTTCGACACATGAGATTATTGAACATCTCTTCTCTGAAGAAAATGTTTCATATATTGGACCAATAAAGCAGGCAGCCAGACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801573.1
MAYEALDDLQQILDQILEHRYDILTHSIKQEIISIRDHSIVLQWNLKHYPNKQRIREAASSTHEIIEHLFSEENVSYIGPIKQAARLAILRELAARLESTVGDVVDCIKGKGSAGSVTDSPDVRSSSRSAITSSKDDDVVGFEQDVKVIKRRLLRGSSKLHVLPIVGTGGIGKTTLVKIVYDDVSAIKHFDICGWVTISQDHSVERIVLNLLASMKGISTVRDAESDIPMETLICEYLMGRKYLIVMDDIWSKKAWDDVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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