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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000482`

染色体: Chr01 坐标: 9896969-9897839 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000482`
名称	SmilChr01G000482
描述	serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9896969 - 9897839 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016835`
GeneID	`131016835`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016835`
原始查询	`LOC131016835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2
产物	serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2
Arabidopsis	`AT2G01950` (BRL2) BRI1-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814726] identity=46.5; qcov=0.688; evalue=2.74e-24; confidence=medium
Rice	`Os10g0114400` (OsBRI1) - identity=40.1; qcov=0.68; evalue=3.27e-26; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016835

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801618.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801618.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801618.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801618.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801618.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9896986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:9897195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr1:9897230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C60
`Chr1:9897237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:9897326`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:9897326`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:9897333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B18,B42,B43,B55
`Chr1:9897337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C60
`Chr1:9897350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:9897351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B120,B140,C24,C25
`Chr1:9897385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:9897392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801618.1

231 aa

116

231

LRR_8

LRR_6

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF13855 LRR_8 84-144 aa PF13516 LRR_6 105-120 aa PF00560 LRR_1 108-127 aa PF13516 LRR_6 133-145 aa PF00560 LRR_1 133-150 aa PF00560 LRR_1 158-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801618.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	84	144	3.2e-14	53.1	Leucine rich repeat
`XP_057801618.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	105	120	4.4e-08	33.3	Leucine Rich repeat
`XP_057801618.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	108	127	3.8e-09	35.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057801618.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	133	145	4.4e-08	33.3	Leucine Rich repeat
`XP_057801618.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	133	150	3.8e-09	35.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057801618.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	158	176	3.8e-09	35.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945635.1
ATGGAGCAAGGTTGCATCGTCCGTGAGATCACGGCGGCGACGTCCCGCAACGCATACCCATGCACGTTTCACTGCGTCACCTGCAACGATCAACGCCGCGTCACTGCCCTCGATCTTGCCATATCCAACCTCGTCGGACAAATCTTCTCTTCCCCATTTTCCTCACTAGACATACTCATCTCCCTCAACCTCTCCGCCAAATCCTTCGTCGTCAATGCCAACTCTTCTCTCTTACAAATCCCTTACACCGTTAAGGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016835
ATGGAGCAAGGTTGCATCGTCCGTGAGATCACGGCGGCGACGTCCCGCAACGCATACCCATGCACGTTTCACTGCGTCACCTGCAACGATCAACGCCGCGTCACTGCCCTCGATCTTGCCATATCCAACCTCGTCGGACAAATCTTCTCTTCCCCATTTTCCTCACTAGACATACTCATCTCCCTCAACCTCTCCGCCAAATCCTTCGTCGTCAATGCCAACTCTTCTCTCTTACAAATCCCTTACACCGTTAAGGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801618.1
MEQGCIVREITAATSRNAYPCTFHCVTCNDQRRVTALDLAISNLVGQIFSSPFSSLDILISLNLSAKSFVVNANSSLLQIPYTVKELELSFSGIIGHIPEKMFTNCPNLEYVNLAFNNITGFLPENLLLHIDKLKYLDFSYNNISGMISDLKIERCSSLSHLDWSGNQIAGSLPPSSEADYAAEFCLRRNPLRFRRAEKPANPRPHPQPPHRLDPIGARQHVCLPLSTSSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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