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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000282`

染色体: Chr03 坐标: 3207949-3237037 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000282`
名称	SmilChr03G000282
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3207949 - 3237037 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016837`
GeneID	`131016837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016837`
原始查询	`LOC131016837`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=27.9; qcov=1.06; evalue=9.68e-82; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=28.9; qcov=1.03; evalue=2.59e-87; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801589.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801589.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801589.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801589.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801589.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3234237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr3:3234315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B55,C29,C31,D7
`Chr3:3234316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,D3
`Chr3:3234345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B102,B123,C46
`Chr3:3234531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,D8
`Chr3:3234567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C17
`Chr3:3234584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:3234625`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B56
`Chr3:3234625`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B56
`Chr3:3234658`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A20,B122,B133,B62,B71,B92,B97,C40,C45,C56,C69,C74,C79,C82,C87,C9,D5,D6
`Chr3:3234664`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A20,B133,B62,B71,B92,B97,C11,C40,C45,C69,C74,C79,C82,C87,C9,D5,D6
`Chr3:3234726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801589.1

842 aa

421

842

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 158-331 aa PF23559 WHD_DRP 411-483 aa PF23598 LRR_14 533-713 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801589.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	158	331	3e-41	141.6	NB-ARC domain
`XP_057801589.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	411	483	3.3e-18	66.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801589.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	533	713	8e-22	78.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099232.1
CGTCCTCCACTTGCAAAAATAAAGTAGACAATCCATTGGCTTTATTGTAAAAGGAAAACATATGGTTGGTCAATAATGAATAATTTATCTCTCAGTCTTCTAAACTAGCCCTGCTCTGTTTCAGCCATTCTTCCAGCTTAGTTTATCTTTATCTGCAAAAATCTAGTAGCAAAAACTTAACTGTGATCACCAAAGATGGCTTATGCTGCTCTTCTTTCCCTCGCCCGAACCACTGCAGAAATAATCTTGGATCAAGATAG...

XR_009099235.1
CGTCCTCCACTTGCAAAAATAAAGTAGACAATCCATTGGCTTTATTGTAAAAGGAAAACATATGGTTGGTCAATAATGAATAATTTATCTCTCAGTCTTCTAAACTAGCCCTGCTCTGTTTCAGCCATTCTTCCAGCTTAGTTTATCTTTATCTGCAAAAATCTAGTAGCAAAAACTTAACTGTGATCACCAAAGATGGCTTATGCTGCTCTTCTTTCCCTCGCCCGAACCACTGCAGAAATAATCTTGGATCAAGATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016837
ATGGCTTATGCTGCTCTTCTTTCCCTCGCCCGAACCACTGCAGAAATAATCTTGGATCAAGATAGATATTCCATTTCTTGTAATAAAAAACAACAAATTCGATCTATCTATGAACCATTTATTTTCTTGCAGGAGTTTCTTGAAGATTTTCCCGAAAAAGCCAACATCTTGGATGGGCGAATTAGAGATTTAGCATATGAAGCAGAACATATTATTGAGTCTTTCATATTGGTGGAAGCTGCATCACATTGGTGGAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801589.1
MAYAALLSLARTTAEIILDQDRYSISCNKKQQIRSIYEPFIFLQEFLEDFPEKANILDGRIRDLAYEAEHIIESFILVEAASHWWNVLAAKSKLKRQIRKIRNETDSITREVMIIKNNSADTVQLGASSSAAAGSPSRSAPIIKIGYMVGLHEDLLTIKSRLCGESPNLEVIPIVGMGGIGKTTLAKCVYDDPLTVQRFDIRAWVTVSQDYNADVVLSALLASMEEFDKDRSEESKDRSKEEEELPGAKVHKILKGRRYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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