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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000098`

染色体: Chr03 坐标: 1084505-1095760 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000098`
名称	SmilChr03G000098
描述	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1084505 - 1095760 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016851`
GeneID	`131016851`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016851`
原始查询	`LOC131016851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
产物	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
Arabidopsis	`AT5G10530` (AT5G10530) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830918] identity=45.6; qcov=0.986; evalue=3.31e-180; confidence=high
Rice	`Os07g0569550` (OJ1019_E02.19) - identity=47.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00139 (Lectin_legB); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016851

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801611.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801611.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801611.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801611.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1094458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B54,B59,B71,C53
`Chr3:1094683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,B98,C81
`Chr3:1094693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B53,B71
`Chr3:1094693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B71
`Chr3:1094880`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A15,A16,B11,B16,B18,B26,B4,B74,C39
`Chr3:1094936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:1095052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr3:1095058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C81,C86
`Chr3:1095091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr3:1095144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr3:1095151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr3:1095155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801611.1

647 aa

324

647

Lectin_legB

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00139 Lectin_legB 22-274 aa PF00069 Pkinase 344-611 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 345-612 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801611.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	22	274	3.6e-58	197.7	Legume lectin domain
`XP_057801611.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	344	611	4.1e-51	174.6	Protein kinase domain
`XP_057801611.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	345	612	5.5e-48	164.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945628.1
CTGTTTCGTGTGTTGATTGGGACCACTTATATAAGTGTCTCTTGTCTTACAAGAGAAGTTAGAAATGAAGATTATCAATTTCCTCCTCTCATTCTCCCTATCTTCCTCTCTTGTCTGGAATTTACATTTCAATCGCAAATCTATCACTTAATTCTCTGTTTACATATCTGGACCACTACAAGAAGTCAAGTCGCCGAAATTATTTGACTTGGTAAAAAAGACTCCGTCATCAAGTCTTCCCCAATAATTTTTAAATTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016851
ATGTGGACATCTTCCATTTCCATGTTTGTGTTCCTGGCGTTGATCATCCCTGCAACAGTCTCACTGAACTTCAACATGTCTCCCATCAGTAGATCAGACGGCGGCCGCTTCAACTTCACGGGCGACGCTTACATCGCCGAAGACGGCATCCAAGTCACAACCAACGAGCACGACCAAGCGCGGGTGGACAGAGCCGGGCGAGCCACCTACCTCGAGACGCTGCACTTGTGGGACAAGGCTTCACAGAAGCTGGCTGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801611.1
MWTSSISMFVFLALIIPATVSLNFNMSPISRSDGGRFNFTGDAYIAEDGIQVTTNEHDQARVDRAGRATYLETLHLWDKASQKLADFSTHFSIVIDSYGSDNFGDGLAFFLAPQGSSIKPWSYGSRLGLGHGSSPVDSSSLESFVAVEFDTFPNRGYPPSNGGPVVPHVGIDLNSITSVATTTWYNNISAGWENNVWVTYSSTTKILRVDFTGNSNGIFRQHNLSYEVDLRNYLPEYVTVGFAAATGGLFEKNNVKSWNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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