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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000045`

染色体: Chr03 坐标: 493017-497132 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000045`
名称	SmilChr03G000045
描述	riboflavin biosynthesis protein PYRR, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	493017 - 497132 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016853`
GeneID	`131016853`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016853`
原始查询	`LOC131016853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	riboflavin biosynthesis protein PYRR, chloroplastic
产物	riboflavin biosynthesis protein PYRR%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G47390` (PHS1) cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823893] identity=74.1; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0473000` - identity=71.8; qcov=0.784; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008703 (5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase activity); GO:0008835 (diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase activity); GO:0009231 (riboflavin biosynthetic process); GO:0050661 (NADP binding)
KEGG	smil00740 (Riboflavin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01872 (RibD_C); PF08719 (NADAR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016853

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801615.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057801615.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801615.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801615.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801615.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:493154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:493214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:493231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B14,C3,C34
`Chr3:493268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:493322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:493373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr3:493961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr3:494042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,D6
`Chr3:494065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:494174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:494239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B82
`Chr3:494251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801615.1

607 aa

304

607

RibD_C

NADAR

PF01872 RibD_C 195-396 aa PF08719 NADAR 433-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801615.1`	Pfam	`PF01872`	RibD_C	Domain	195	396	5.2e-44	151.1	RibD C-terminal domain
`XP_057801615.1`	Pfam	`PF08719`	NADAR	Domain	433	586	8.5e-36	124.4	NADAR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945632.1
GCCTCATTGGTGCTTACTTTATATCCAAACGGAAAAAAAAAATCCCATTTGCTTGAAACTTCCCAACACTCTGACCCACTACTTTTTCCGGCGAGATAATTCCGGCAATTGGAGGCGGAAGCCGTCGCCGGAGATGATGGCATTCTCAATTCCACCCGCGATAATCCCTTCCCGCGTGACCTGCAGAGCGACTCTCGCTTCTTCATCCTCATCGCCATCGTCGCTCGCCTTCGACGCCGCCTACATCAAACGGGCCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016853
ATGATGGCATTCTCAATTCCACCCGCGATAATCCCTTCCCGCGTGACCTGCAGAGCGACTCTCGCTTCTTCATCCTCATCGCCATCGTCGCTCGCCTTCGACGCCGCCTACATCAAACGGGCCGCCGATTTAGCCGACAAATCCGCCGGGTTCACGGCGCCGCACCCGAACTACGGCTGCGTCATTGCCACCAGCTCAGGTAGTGGAGAGAAGGTTGTGGTCGGAGAAGGGTATTTGTATGCTCAGGGCACCTCGCCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801615.1
MMAFSIPPAIIPSRVTCRATLASSSSSPSSLAFDAAYIKRAADLADKSAGFTAPHPNYGCVIATSSGSGEKVVVGEGYLYAQGTSPAELEAVEAAGERCRGATAYLNMEPNHCLGDQAAVSALLQAGIARVVIGIRHPLEHLRGKAIRAFRSQGLLVDVLGEDLQCKAIEESLKSCLLVNAPLLYRAASQVPFSLLKYAMTLDGKIAASSGHASWISSKRSRTRVFELRGRSDAVIVGGNTVRRDNPQLTARHGGGHLPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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