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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000198`

染色体: Chr03 坐标: 2260024-2265235 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000198`
名称	SmilChr03G000198
描述	V-type proton ATPase subunit H-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2260024 - 2265235 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016883`
GeneID	`131016883`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016883`
原始查询	`LOC131016883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase subunit H-like
产物	V-type proton ATPase subunit H-like
Arabidopsis	`AT3G42050` (AT3G42050) vacuolar ATP synthase subunit H family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823170] identity=75.7; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0549700` - identity=71.6; qcov=0.241; evalue=3.47e-52; confidence=weak
GO	GO:0000221 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase, V1 domain); GO:0005515 (protein binding); GO:0020037 (heme binding); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03224 (V-ATPase_H_N); PF11698 (V-ATPase_H_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016883

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801650.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801650.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057801650.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057801650.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057801650.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2260510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:2260519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:2260526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B6,B76
`Chr3:2260557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A18,B106,C58
`Chr3:2261519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B10,C31
`Chr3:2261536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:2261551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:2262314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:2264120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B66
`Chr3:2264461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C32,C68
`Chr3:2264557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A7,C24,C78,C85
`Chr3:2264802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B34,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801650.1

453 aa

226

453

V-ATPase_H_N

V-ATPase_H_C

PF03224 V-ATPase_H_N 11-324 aa PF11698 V-ATPase_H_C 330-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801650.1`	Pfam	`PF03224`	V-ATPase_H_N	Repeat	11	324	8.5e-85	285.7	V-ATPase subunit H
`XP_057801650.1`	Pfam	`PF11698`	V-ATPase_H_C	Repeat	330	442	3.4e-42	144.0	V-ATPase subunit H

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945667.1
TAAAATGAATATAAAATTTAAAAAACGTTAATACAAAAAATCACATATAACTACCATTTTGTTTGATTGGTTTCTGCTGCTCACGCTCTCTCTCTACACTGGCGGATTTTCTCTCTCTAGATTCCGATCTGTTTCAGGCAAACTCAGAGAATGCCAGCGGACCACGGGGAGCTCTCCTCCGACGAGGTCTTGAGGAGGGATATTCCATGGGAGACTTATATGACGACTAAGCTGATCACGGGGACCGGGCTTCAGCTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016883
ATGCCAGCGGACCACGGGGAGCTCTCCTCCGACGAGGTCTTGAGGAGGGATATTCCATGGGAGACTTATATGACGACTAAGCTGATCACGGGGACCGGGCTTCAGCTGCTGCGGCGGTATGATAAGAAGCCGGAGGCTTACAAGGCTCAACTGCTGGATGATGATGGTCCATCTTATGTTCGTATCTTTGTGAGTATTTTGCGCGACATATTCAAGGAAGAAACTGTTGAATATGTATTGGCTCTTATTGATGAAATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801650.1
MPADHGELSSDEVLRRDIPWETYMTTKLITGTGLQLLRRYDKKPEAYKAQLLDDDGPSYVRIFVSILRDIFKEETVEYVLALIDEMLSANPKRARLFHDKSLSNEDIYEPFLRLLWKGNWFIQEKSCKILSMIVGERPKSHETATSNGASHSKKELTTTDEVFKGLIEWLSTQLKKPSHPSRSVLTAINSLATLLREPSARSLFVQEDGVKLLIPLINPVSNQQSIQLLYETCLCVWLLSYYEPAIEYLATSRSLPRLIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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