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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000245`

染色体: Chr03 坐标: 2909013-2913172 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000245`
名称	SmilChr03G000245
描述	uncharacterized SmilChr03G000245
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2909013 - 2913172 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016887`
GeneID	`131016887`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016887`
原始查询	`LOC131016887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=28.5; qcov=0.946; evalue=2.91e-43; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016887

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801659.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057801659.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057801659.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801659.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801659.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2909441`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr3:2909441`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr3:2909459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,B99
`Chr3:2909461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C44
`Chr3:2909480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A19,B120,B4,B53,B55,B88,C14,C47,C52,C57,C73,C74,C77,D11
`Chr3:2909496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B89,C8
`Chr3:2909498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B78,D9
`Chr3:2909498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D9
`Chr3:2909523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C80
`Chr3:2909549`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B117
`Chr3:2909549`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B117
`Chr3:2910132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801659.1

427 aa

214

427

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 343-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801659.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	343	427	2.1e-12	48.3	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945676.1
CTCAATCAATTATCTCCTCGCAACTAACCTCAAAGTCATTCTTCCGCACCATCGCATACAACCTCGCCGCCGCTGTGAGCCTCCGGTCCGCCGCGCTTCACCGTTGCTCTTAGTCTTTTTTCCGGTCGCCGCCTCCCCTCTTCGAAGGCCGGTTGAGGTCACCCGACAAGTTAAACACTTCGAAGAGAACCATTCCGTTCGATTTCTCGCTTAATTAGTCGGGCAGAGAAGCTTGAAGGTGATCTATCAAGGTCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016887
ATGAACATGGAAGTTACATTGCGCAAAACAAGCTCATCTTCAGCTAATGAGGTATATAGACAAAGAAAAAATCTACAAAGACAAAAGAAACGTAAACGAAATGCAAGTGATTTGAATTGTTCATTGCTACATGAATTGAAAAATGTGCCTGATTGCATTCATTGTGGTGCAAGAAGATTTGAATATGAACCTCCTACTTTTTGTTGTGATAATGGAAAAGTTAAACTTGCATTTTCTGAAGTTCCTCCGGAGTTGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801659.1
MNMEVTLRKTSSSSANEVYRQRKNLQRQKKRKRNASDLNCSLLHELKNVPDCIHCGARRFEYEPPTFCCDNGKVKLAFSEVPPELDELFTAQSEEAINFRRNIRAYNSIFSFTSFGVKLDKELASARRGVYSFQAQGMVYHDLPGLIPQYTSPTFFQLYFYDTQSEFENRINIMQNQVLSEAVVQMLMKILEINPYAKFFRRLKDYPSMDNVQLHISKDVNLDQRVYNSPHADQVAAIWVEGNNENIPLERDIVVHAHSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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