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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000046`

染色体: Chr03 坐标: 497834-499314 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000046`
名称	SmilChr03G000046
描述	dirigent protein 24-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	497834 - 499314 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016895`
GeneID	`131016895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016895`
原始查询	`LOC131016895`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 24-like
产物	dirigent protein 24-like
Arabidopsis	`AT2G39430` (AT2G39430) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818528] identity=56.4; qcov=0.588; evalue=4.35e-81; confidence=medium
Rice	`Os03g0280750` - identity=54.6; qcov=0.57; evalue=4.1e-75; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057801666.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057801666.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801666.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801666.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:497971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B12,B138
`Chr3:498003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:498224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:498452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:498458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr3:498500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr3:498551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C70,C75
`Chr3:498552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B130,B137,B85,C10
`Chr3:498557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:498593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B62,B94,C63
`Chr3:498613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B43,B47
`Chr3:498634`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A8,C47,C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801666.1

398 aa

199

398

Dirigent

PF03018 Dirigent 255-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801666.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	255	396	7.2e-30	104.4	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945683.1
ATCAATCAAACACTTGAAATGTGTGATAATTAAAGGGCCAATTTTAACTAACCAACTCCATCTCATCAGCTCCACTCTCTCATTCCCTACTAAACTATAAAACTATAAATACCAATTAGTCAATCTCAACATTCATATCAAAATCAAACACATCTCAACCAAAAATGGCTAAGCATCACACTCTCACCTCCTTCTTTTGCTTGTTGCTACTAGCCACCACCCTCACCCTAGTCACCTCAGCAAGAATTCTTGATGAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016895
ATGGCTAAGCATCACACTCTCACCTCCTTCTTTTGCTTGTTGCTACTAGCCACCACCCTCACCCTAGTCACCTCAGCAAGAATTCTTGATGAAGAAACACCTCCATTCCCCCTCCCCGCCGCCTCCTCCGATCCGATCCCACCGCCGGAGACGGTGGCTCCGGCCACAACTGCCCTCCCGAGCGGTCAAATCCCGGCAGTCCCCACCACCAATGTTGCCCCGCCCGAGCCCACCCCAATAGAAGAAGAACCCGCCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801666.1
MAKHHTLTSFFCLLLLATTLTLVTSARILDEETPPFPLPAASSDPIPPPETVAPATTALPSGQIPAVPTTNVAPPEPTPIEEEPAANVAPPEHTPIEEEPAAVPATNVAPPEPTPIEEEPAAVPATNVAPPEPTPTVEEPAAPAVAPVVPTTTNVAPPKTTAAPLGGAAAAAFSFFMHDVLGGSHPSGRAVAGIVANSDANNLPFSKPSNPIFPINGGVPLNTVNGAINSNNYPFLVGLNGAPSSTLVQSNGNNAVAGNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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