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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000483`

染色体: Chr01 坐标: 9898348-9899628 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000483`
名称	SmilChr01G000483
描述	uncharacterized SmilChr01G000483
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9898348 - 9899628 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016904`
GeneID	`131016904`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016904`
原始查询	`LOC131016904`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=26.3; qcov=0.437; evalue=2.42e-13; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=32.2; qcov=0.408; evalue=3.47e-20; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016904

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801722.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057801722.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801722.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801722.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9898407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C72
`Chr1:9898427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B24,B68
`Chr1:9898476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,C24,C78,C85,D7
`Chr1:9898478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B121,B136,B76,C53
`Chr1:9898507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:9898552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A10,A5,C65,C74
`Chr1:9898552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A5,C65,C74
`Chr1:9898676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B24,B68,C85
`Chr1:9898703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:9898733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	96	A14,A16,A20,A21,A25,A6,A7,A8,B1,B10,B101,B102,B108,B109,B110,B113,B117,B12,B121,B127,B128,B139,B15,B18,B19,B21,B22,B25,B26,B27,B28,B30,B31,B37,B38,B39,B42,B43,B44,B47,B50,B52,B60,B61,B62,B63,B64,B68,B69,B73,B74,B76,B77,B8,B85,B86,B9,B99,C10,C11,C18,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C35,C41,C43,C44,C47,C49,C50,C52,C55,C6,C61,C67,C69,C73,C74,C75,C79,C80,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D5,D8
`Chr1:9898740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:9898755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801722.1

426 aa

213

426

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 35-109 aa PF14392 zf-CCHC_4 203-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801722.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	35	109	7.3e-09	35.9	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057801722.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	203	225	3.6e-06	27.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945739.1
ATGGATCCAGATGAGATCCAAAGGCTGGTGGATCAACTACAACTTACGGAGGAGGCGGACGATTCCACCGTTGCGCTTCCGGCAATGCTTACAGCAAATCTAAAGGATAATCTCAAACTTTGCCTTGCGGGTAAAGTTTTTGCGGGGAAACAAGTGAGCCGTGATCAATTACTTCAATATCTTCCTAGCATATTAATGGCACAACAACGTATTGAAGTGGAGATTGTAGGGGCGAATTTATTTGTTGTCCAGTTTACGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016904
ATGGATCCAGATGAGATCCAAAGGCTGGTGGATCAACTACAACTTACGGAGGAGGCGGACGATTCCACCGTTGCGCTTCCGGCAATGCTTACAGCAAATCTAAAGGATAATCTCAAACTTTGCCTTGCGGGTAAAGTTTTTGCGGGGAAACAAGTGAGCCGTGATCAATTACTTCAATATCTTCCTAGCATATTAATGGCACAACAACGTATTGAAGTGGAGATTGTAGGGGCGAATTTATTTGTTGTCCAGTTTACGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801722.1
MDPDEIQRLVDQLQLTEEADDSTVALPAMLTANLKDNLKLCLAGKVFAGKQVSRDQLLQYLPSILMAQQRIEVEIVGANLFVVQFTSLLDKKHALHGGPWHLFQDLIAFAEIEGFQNPTDVKFEFFTGWIQCHNLPMACMHPDVVRRIGEQIGTVEDIDMGVGGMCRGRFARVRVRWSLSRPLQRCVRILPDGEMQGVIVILLYEKLPNFCYRCGRIGHLFHLCETPGNDKEDFKYGAWLMAPKPIEIRKKQSWAKENTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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