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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000419`

染色体: Chr03 坐标: 4524663-4526345 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000419`
名称	SmilChr03G000419
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4524663 - 4526345 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016907`
GeneID	`131016907`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016907`
原始查询	`LOC131016907`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
产物	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
Arabidopsis	`AT1G56670` (AT1G56670) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842122] identity=44.2; qcov=0.945; evalue=1.04e-99; confidence=medium
Rice	`Os01g0329900` (OsGELP14) - identity=41.7; qcov=0.918; evalue=2.66e-87; confidence=medium
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016907

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057801691.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057801691.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801691.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801691.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4524721`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A4,A5,B114,B127,B133,B28,B3,B37,B44,B5,B54,B55,B57,B62,B75,B86,B88,C14,C34,C41,C47,C5,C53,C81,C84,D11,D6
`Chr3:4524733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:4524757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:4524761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B71
`Chr3:4524793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr3:4524934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B132
`Chr3:4525083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B111,B137,B45,C31
`Chr3:4525112`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A16,B103,B81,C49,C55,C57
`Chr3:4525128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B132,B85,C63
`Chr3:4525149`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B64,B67
`Chr3:4525149`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B64,B67
`Chr3:4525170`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B14,B15,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801691.1

366 aa

183

366

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 58-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801691.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	58	349	6.8e-41	141.4	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945708.1
GAGTAATGCTTTTAAGCCATCGCATTCTCTCCTTTTGCATCTTCCTATCCTTTCCAACTAAAAAAAACAAGAAAATGTATTATTCCAGCAAAATCTCCCTTGCTCTCGTGGGCTTCTTCTTCCTTGGCTTCGGCACCACCACGGCGACGGCGGCCGCTTGCAGCAACGAACCACTAATATTCAACTTCGGAGACTCCAACAGCGACACCGGTGGCGCTTCCGTTCTTGCAGGGGGGGAGCTCGAGTTCCCGGAGGGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016907
ATGCTTTTAAGCCATCGCATTCTCTCCTTTTGCATCTTCCTATCCTTTCCAACTAAAAAAAACAAGAAAATGTATTATTCCAGCAAAATCTCCCTTGCTCTCGTGGGCTTCTTCTTCCTTGGCTTCGGCACCACCACGGCGACGGCGGCCGCTTGCAGCAACGAACCACTAATATTCAACTTCGGAGACTCCAACAGCGACACCGGTGGCGCTTCCGTTCTTGCAGGGGGGGAGCTCGAGTTCCCGGAGGGGCGAACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801691.1
MLLSHRILSFCIFLSFPTKKNKKMYYSSKISLALVGFFFLGFGTTTATAAACSNEPLIFNFGDSNSDTGGASVLAGGELEFPEGRTFFHEPTGRASDGRLILDFLCESLETKFLTPYLELFFPDFSNGVNFALGGADSRLARTDLKAVAYTLGNEIAEFSRFRNVSVRRGSLDAGQVKSALFMLDIGQNDIQFDSNTLTPQQVLERVPRIVSNIGEAMQKLYQLGGRNFWVHNTGPLGCLPFNVARINASTVVDEYGCVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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