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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000038`

染色体: Chr03 坐标: 459017-461513 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000038`
名称	SmilChr03G000038
描述	peroxidase 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	459017 - 461513 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016920`
GeneID	`131016920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016920`
原始查询	`LOC131016920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 5-like
产物	peroxidase 5-like
Arabidopsis	`AT1G05260` (RCI3) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837028] identity=44.2; qcov=1.01; evalue=4.52e-86; confidence=medium
Rice	`Os01g0327400` (prx16) - identity=55.7; qcov=0.963; evalue=2.39e-108; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057801706.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057801706.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801706.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801706.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801706.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:459129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:459202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C33
`Chr3:459267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:460593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B95
`Chr3:460599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B137,B25,C17,C41
`Chr3:460601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B15,C60
`Chr3:460693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:460710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,B89
`Chr3:460717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr3:460740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C75
`Chr3:460774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:460782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801706.1

326 aa

163

326

peroxidase

PF00141 peroxidase 43-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801706.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	43	290	2.1e-81	273.9	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945723.1
TCTACTCAATAAATCCATCATCACCTCCATATTTCTTTCACAATCACACATATATATCATCAAGAATGGGTTCTTTCTCAATCATGGCAGCAGTGATGCTCTCTTGCTTCCTCGTCTTTGTCTCCGCCGTTTCCTCTGCGCCACTCACAGTGGGCTTCTACAGATATTCTTGCCCACTTGCCGAAGCCATTGTCCAAAAACACGTCAACAAGTTCGCCTCGCGCAACCCCGGCCTCGCGGCCGGCCTCATCCGCCTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016920
ATGGGTTCTTTCTCAATCATGGCAGCAGTGATGCTCTCTTGCTTCCTCGTCTTTGTCTCCGCCGTTTCCTCTGCGCCACTCACAGTGGGCTTCTACAGATATTCTTGCCCACTTGCCGAAGCCATTGTCCAAAAACACGTCAACAAGTTCGCCTCGCGCAACCCCGGCCTCGCGGCCGGCCTCATCCGCCTGCATTTCCACGACTGCTTCGTCAGGGGATGCGATGCATCGGTGCTGCTGGACGGGCCGACGTCGGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801706.1
MGSFSIMAAVMLSCFLVFVSAVSSAPLTVGFYRYSCPLAEAIVQKHVNKFASRNPGLAAGLIRLHFHDCFVRGCDASVLLDGPTSEKESIPNKGSLRGFEVIDAAKAELELRCPKTVSCADVLAFAARDSSAKLGNIHYAVPSGRRDGRVSSASEPLLSLPPPFFNATSLRDNFAAKGLSLDEMVTLSGAHSVGISHCSSFSSRLYPAADPSMDPKYAALLKGKCPSPRPASAGNAAAVDPTVDLDPITPDCLDNKYYVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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