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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000402`

染色体: Chr03 坐标: 4385403-4386431 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000402`
名称	SmilChr03G000402
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4385403 - 4386431 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016927`
GeneID	`131016927`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016927`
原始查询	`LOC131016927`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G10920` (LOV1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837635] identity=34.1; qcov=1.08; evalue=1.23e-54; confidence=low
Rice	`Os11g0629550` - identity=33.9; qcov=0.991; evalue=8.58e-57; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016927

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801714.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057801714.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801714.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801714.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4385410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B132,C85
`Chr3:4385416`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B3,B4,C43,C82
`Chr3:4385416`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B3,B4,C43,C82
`Chr3:4385424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C2
`Chr3:4385426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,C10,C29,C55
`Chr3:4385431`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B104,B112
`Chr3:4385431`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B104,B112
`Chr3:4385432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B2,C53,C70,C83
`Chr3:4385447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:4385472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B1,B110,B75,B82
`Chr3:4385496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr3:4385511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C48,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801714.1

316 aa

158

316

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 2-85 aa PF23559 WHD_DRP 170-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801714.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	2	85	1.2e-18	68.0	NB-ARC domain
`XP_057801714.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	170	240	2.4e-22	79.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945731.1
GATTATAGTGAAGAAAGAATTCTTTCAAACATCTTCGATTCCTTGAAAGAATTCAACCGAGAAAGGGATGATAGATCCATGGCGGAGAAAGTGTACAAAATCCTAGTAGGCAGGAGATTTTTTATTGTGATGGATGATATGTGGAGCACCAAGGTACTGAATGATGTAAAGAAGTTGTTTCCTGACGACAACAATGGGAGTCGAATTCTGTTAACCACAAGGTTGGTAGATGTTGCTGCTTATGCCAACTCTTCCACGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016927
ATGGCGGAGAAAGTGTACAAAATCCTAGTAGGCAGGAGATTTTTTATTGTGATGGATGATATGTGGAGCACCAAGGTACTGAATGATGTAAAGAAGTTGTTTCCTGACGACAACAATGGGAGTCGAATTCTGTTAACCACAAGGTTGGTAGATGTTGCTGCTTATGCCAACTCTTCCACGCCTTCCCATAAGATGCGTTTGATGGATCCGTGTCAGAGCTGGAATCTACTACGAGAGAAGGTGTTCGGACACCAAGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801714.1
MAEKVYKILVGRRFFIVMDDMWSTKVLNDVKKLFPDDNNGSRILLTTRLVDVAAYANSSTPSHKMRLMDPCQSWNLLREKVFGHQDSVPRELEAIGREIARSCGGLPLATMVVAGLLSSVSKTPTSWEEIAKNVRSSLATTDGRVQKILSLSYNHLPHHLGACFLHMGGFPEDHEIKVENLKRLWIAEGFVKPVASKSFEDRAEEYLEDLIRRSLVIVSNNKSNGKIKSCRLHDLVRDLCIKKSQEEKFLVHVKGRRALE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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