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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000344`

染色体: Chr03 坐标: 3889500-3892927 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000344`
名称	SmilChr03G000344
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3889500 - 3892927 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016933`
GeneID	`131016933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016933`
原始查询	`LOC131016933`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=37; qcov=0.909; evalue=1.08e-34; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=33.2; qcov=0.922; evalue=1.34e-37; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801723.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801724.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801723.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057801723.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3889845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:3889891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:3889912`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	60	A20,A21,B10,B100,B101,B106,B108,B111,B120,B121,B129,B132,B134,B137,B139,B16,B19,B28,B42,B43,B49,B51,B62,B66,B69,B70,B79,B82,B87,B89,B90,B92,B93,B97,C11,C15,C23,C25,C32,C38,C4,C50,C51,C52,C56,C61,C65,C68,C69,C7,C70,C72,C75,C77,C79,C82,C9,D2,D5,D9
`Chr3:3889924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B135,C12,C65
`Chr3:3889925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:3889927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:3889934`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A20,A21,B10,B100,B101,B106,B108,B111,B120,B129,B132,B134,B137,B139,B16,B19,B27,B28,B42,B43,B49,B51,B62,B66,B69,B70,B79,B82,B87,B89,B90,B92,B93,B97,C11,C15,C23,C25,C32,C38,C4,C50,C51,C52,C56,C61,C65,C68,C69,C7,C70,C72,C75,C77,C79,C82,C9,D5,D9
`Chr3:3889937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:3889941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B20,B42,C37,C78
`Chr3:3889965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:3889968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:3889969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801723.1

295 aa

148

295

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 4-74 aa

XP_057801724.1

232 aa

116

232

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 28-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801723.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	4	74	2.1e-20	73.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801724.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	28	195	4.1e-40	137.9	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945740.1
TTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACAAACACAGTACTTTTGTCATCTTCCAAACCATTTGACTTCATCATTAAGCCTTGGTCGAAAAGTTTGATCTTCAGCAATGGCTTTTGCTGCTCTTGTTTCGGTAGCACAAGTCAGAGACCAAATTCTGAATCATGACCAATAATATCCCATTCCTATTCCTTCGGTATAATAAATTGCATCAATCCATTTCCACACTACTTTCTCTCAGTCACTACTCGATCATTTTTCAAC...

XM_057945741.1
TTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACAAACACAGTACTTTTGTCATCTTCCAAACCATTTGACTTCATCATTAAGCCTTGGTCGAAAAGTTTGATCTTCAGCAATGGCTTTTGCTGCTCTTGTTTCGGTAGCACAAGTCAGAGACCAAATTCTGAATCATGACCAATAATATCCCATTCCTATTCCTTCGGTATAATAAATTGCATCAATCCATTTCCACACTACTTTCTCTCAGTCACTACTCGATCATTTTTCAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016933
ATGCGATCGAGTGATTCTCCAGCTGCTGCTCCAACATCAACCCTTGCGCCGACGGGAAGAATTGATGCGGTTGGTCTTGATCGCGATGTCGAGGCAATGTTGAGTCGCCTCCGACGAGATGCCGACGAACTCCAAATCATTCCGATAGCTGGCGCAGGAGGAATCGGTAAAACAACTCTGGCTCGAAATGTTTATCACGATCCTTATCTCATAGACAAGTTTGACATTCGTGCTTGGGTTACAGTATCTCAGGATTATAA...

LOC131016933
ATGGGAGCTTTTCCAGAAGATTATGAGATTCGAGTCTCAAAATTGGTGAAACTTTGGATAGCTGAGGATTTGGTAGAATCAACTGCAACCAAAACCCCTGAGGAAGTAGCAGAGGTGTGCCTGGAGGATCTGGTTAAGAGAAATCTTGTTTTGGTTACGAAGAGGAAGTCTAATGGCCGGATCAAGAGCTGTGGCCTTCATGATCTGTTGCGCGACTTGTGCCTTATGAGATCGTTGGAAGAGAATTTTCTACTAACTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801723.1
MGAFPEDYEIRVSKLVKLWIAEDLVESTATKTPEEVAEVCLEDLVKRNLVLVTKRKSNGRIKSCGLHDLLRDLCLMRSLEENFLLTFMGSFFLPEIFATQLRISISHSNILAHIDGSTIHTIICYSHSSVDSLEKFRKLRILDMLNTSVPAQVFELRDLRFLAFSYSDAILESTSNLENLQTLIIYPNDASILVHFPLEIWKMPRLRHLISPSVHPLPHLDGAMSPSENLQTLSLATNFECSERMLEMIPNVKKLGICYY...

XP_057801724.1
MRSSDSPAAAPTSTLAPTGRIDAVGLDRDVEAMLSRLRRDADELQIIPIAGAGGIGKTTLARNVYHDPYLIDKFDIRAWVTVSQDYNFGNIFKNLLVSMKVFVKEDITRLSKEEMALKVYQTLTDRRYLIVIDDMWSTKAWDEIRSYFPNNSNRSRIILATRLKDVAAYVDSSEKFHEMQYLDDFQSLILLKKELCKGECRLPMLEAMENIATKIAKSCGGLPLAIVVTERD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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