当前解析结果
SmilChr03G000068| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000068 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000068 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000068 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 772760 - 775944 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016936 |
|---|---|
| GeneID | 131016936 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016936 |
| 原始查询 | LOC131016936 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0543000; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os08g0543000; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G40070 (AT2G40070)flocculation FLO11-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818595] identity=47.4; qcov=0.344; evalue=8.75e-16; confidence=low |
| Rice | Os08g0543000- identity=40.4; qcov=0.589; evalue=5.3e-23; confidence=medium |
| GO | GO:0043622 (cortical microtubule organization); GO:0055028 (cortical microtubule) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016936 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801729.1 |
| 2 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.60000 | XP_057801729.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801729.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801729.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801729.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:774699 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B14,B23,B62,B97,C3 |
Chr3:774788 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,B21,B7,B85 |
Chr3:774819 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C13 |
Chr3:774867 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr3:774868 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr3:774886 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B27,B5,C38 |
Chr3:774913 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B66 |
Chr3:774944 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B47 |
Chr3:774945 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr3:775018 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B54,C2,C58 |
Chr3:775030 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B47,B97,C37,C47,C56 |
Chr3:775068 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 21 | A1,A19,A24,A25,B1,B108,B109,B111,B136,B15,B16,B35,B53,B58,C14,C18,C36,C63,C69,C73,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。