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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000052`

染色体: Chr03 坐标: 517600-519550 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000052`
名称	SmilChr03G000052
描述	thioredoxin F-type, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	517600 - 519550 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016961`
GeneID	`131016961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016961`
原始查询	`LOC131016961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin F-type, chloroplastic-like
产物	thioredoxin F-type%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G02730` (TRXF1) thioredoxin F-type 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821260] identity=66.9; qcov=0.785; evalue=1.29e-62; confidence=high
Rice	`Os01g0913000` (OsTRXh10) - identity=71.8; qcov=0.724; evalue=4.2e-62; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801787.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057801787.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801787.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801787.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801787.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:518027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:518037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:518988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr3:518998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B57,C46
`Chr3:519033`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	86	A15,A19,A20,A23,A25,A3,A4,B100,B102,B103,B111,B120,B124,B129,B13,B130,B131,B136,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B31,B33,B37,B40,B42,B43,B48,B50,B51,B52,B58,B59,B60,B61,B62,B69,B73,B77,B79,B81,B84,B87,B88,B89,B93,B94,B99,C10,C17,C23,C25,C27,C29,C30,C35,C38,C39,C5,C54,C57,C62,C63,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C83,C84,C87,D2,D3,D9
`Chr3:519040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B5,C79
`Chr3:519055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B48
`Chr3:519082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:519179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801787.1

181 aa

181

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 76-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801787.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	76	173	1.9e-24	86.3	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945804.1
GAATACTATAAAACAAACACCTCATCATTTTTAAGATGAAATCTTCAAATTTTCCTCTTCAATTTTGTGGCAGCAAATCTAGTCCCATTTAGGATTTTTAGCGCCGCAGCCACAAAAATTAGTGGTTAAATGACAAAACACGCCCTAGATATTCGGACAACTAAAAAGATCCCGAGGGTAGTTTCGTCATTTCCCATGCCCCCAAGAAATTAACGGTCCATTTTCGTCGACCCCTCCCCATAAATTCGGCCCTTCATCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016961
ATGGCGTTGCAAGTATACAGTGCGGTGCCAAGGACCTCAATTGTGCAGAGCTCTTGGCTGCATGGAGTTGCGGCGAAGCAGATCTGCGTGGGGAGCGATTACCCCCAGCTGATGAAGATGAAGGAGAGGAGGCTGAGCTTGAGCGTGGGGGTGAGGTGCAGCTTGGATGTGACTGCGGAGACCGCGGCCGAGGTGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGAGGTGGGGAAGGTGACGGATGTTACTAAGGACACCTTCTGGCCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801787.1
MALQVYSAVPRTSIVQSSWLHGVAAKQICVGSDYPQLMKMKERRLSLSVGVRCSLDVTAETAAEVAAVAVAEVGKVTDVTKDTFWPIVKAAGDKTVVVDMYTQWCGPCKVIAPKYQQLSEKYDDVVFLKLDCNDENRPLAKELGIKVVPTFKILKDSKIVKEVTGAKIDNLILAIDAVRSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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