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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000040`

染色体: Chr03 坐标: 470048-471879 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000040`
名称	SmilChr03G000040
描述	uncharacterized SmilChr03G000040
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	470048 - 471879 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016962`
GeneID	`131016962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016962`
原始查询	`LOC131016962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0918200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0918200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G55160` (SUMO2) small ubiquitin-like modifier 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835609] identity=34.1; qcov=0.472; evalue=2.04e-08; confidence=low
Rice	`Os01g0918200` - identity=32.6; qcov=0.478; evalue=3.88e-09; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0031386 (protein tag activity); GO:0044389 (ubiquitin-like protein ligase binding)
KEGG	-
Pfam	PF11976 (Rad60-SLD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801788.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057801788.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801788.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057801788.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:471257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C8
`Chr3:471267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C15
`Chr3:471310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B20
`Chr3:471319`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A6,B104,B105,B107,B11,B118,B18,B20,B30,B42,B5,B73,B74,B91,C10,C14,C15,C33,C40,C46,C48,C52,C64,C66,C70,C78,C8,C82,C85
`Chr3:471326`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A6,B104,B105,B107,B11,B18,B20,B30,B42,B5,B73,B74,B91,C10,C14,C33,C40,C46,C52,C64,C66,C70,C78,C8,C82,C85
`Chr3:471404`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B104,B105,B18,B73,B91,C40,C46,C52,C66,C85
`Chr3:471406`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B104,B105,B18,B73,B91,C40,C46,C52,C66,C85
`Chr3:471459`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B36,B83,C60,D9
`Chr3:471459`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B36,B83,C60,D9
`Chr3:471460`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A18,A20,A7,B101,B104,B112,B129,B138,B22,B33,B42,B60,B64,B72,B74,B80,B81,C11,C40,C57,C59,C64,C68,C70,C8
`Chr3:471465`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A18,A20,A7,B101,B104,B112,B129,B138,B22,B33,B42,B60,B64,B72,B74,B80,B81,C11,C40,C57,C59,C64,C70,C8
`Chr3:471468`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B36,B83,C60,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801788.1

180 aa

180

Rad60-SLD

PF11976 Rad60-SLD 23-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801788.1`	Pfam	`PF11976`	Rad60-SLD	Family	23	83	4.2e-14	52.8	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945805.1
TTTTCGTTTTGCCCTTTTCCCCCCATTCAACACTTCGGATTTGCTCCTTCTCTCTCTATACCTCTTCCTTTACTTCGCGAGAGTCTCTTCAGACTCTGCCCTCTATTTGATTCCCTTGAGATCGGTTTGTGAGGAAGACAGACAGAGATGGTGAAGGAAGAAAGTGGAATGATGACGATTCACATACAGATTAAGGAAGCCGGAATAGGCCAACGGCGGCGGAAACTCAGCTTTACAACGGAGAAGAGTCTCCCCTTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016962
ATGGTGAAGGAAGAAAGTGGAATGATGACGATTCACATACAGATTAAGGAAGCCGGAATAGGCCAACGGCGGCGGAAACTCAGCTTTACAACGGAGAAGAGTCTCCCCTTGCGAAGGATCTTTCTCGACTTCTGCTATCAACTCAACCTCGATTATGACGACATTCGCTTTCGTTTTGATGGCAGGCGACTAAACAAAGACAAAAGTGCAGAGGAATGTGAAATAGAAGACGGTGGTGTCATCGAGGCTTTCCGTTGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801788.1
MVKEESGMMTIHIQIKEAGIGQRRRKLSFTTEKSLPLRRIFLDFCYQLNLDYDDIRFRFDGRRLNKDKSAEECEIEDGGVIEAFRCLCGGEESGLITIHIRIEQFGKGQRWRKLSFTTEKSLPMRRIFLDFCDQLNLRCNDFAYILVARNEARSLDKDKTAEEYGIEDGDVIDAIPHMYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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