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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000043`

染色体: Chr03 坐标: 486808-487809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000043`
名称	SmilChr03G000043
描述	uncharacterized SmilChr03G000043
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	486808 - 487809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016971`
GeneID	`131016971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016971`
原始查询	`LOC131016971`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=37.7; qcov=0.349; evalue=4.41e-08; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057801807.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057801807.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057801807.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801807.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:487147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:487167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C20
`Chr3:487176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:487177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:487180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B114,B133
`Chr3:487181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:487191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C51
`Chr3:487237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B125
`Chr3:487255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B72,C53,C85
`Chr3:487266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:487281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B87
`Chr3:487281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801807.1

152 aa

152

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 41-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801807.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	41	74	4.8e-07	30.5	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945824.1
AAGGTGCAGATAGGCCCCTTAAGTGGGAGCCCTTAGAGCGTTTTACTCCCCATACTAACTGTGTGTGCAATTTAACCCCTAAACTACCAAAAATCACACATTTAAGCCCCCACGACCAAACGCCGTTAGTCAACGTCCGATTTTTTTTTTTTTTAATTTTAATGCAAATGCTGGGGCCCACTATTAACGATTTGCAACGGCCTTTTAATTTGGGGCATTTTTCATAAACGAAAGAACCCTAATTCGCGATTAGGGCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016971
ATGAGTTTCAATTCAGGGAGTGGGTCTAACTCGTCGCGGGATTGGCGGCAGAGGAAGAACGAGTATGAGGGTGATTCGAGGTATTGTTTTTGCGTGAATGAAGGTAAGAGGTTGAAAGCCCCGATAAGAACTTCATGGACCGAAGACAACCCCGGAAGAAGGTTCTACGGCTGTAAAAATTGGAAGACCAAAAAATGTAGATATTTCAAATGGCACGATGAGCCTATGGGTGAGAGAGCTATTGAAGTTATAAATGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801807.1
MSFNSGSGSNSSRDWRQRKNEYEGDSRYCFCVNEGKRLKAPIRTSWTEDNPGRRFYGCKNWKTKKCRYFKWHDEPMGERAIEVINELKNENLKLIEMNSRSATPSDVEAEIGLLWDMIEGLKDESKRARTTNRLFVSILIVSWLVLIYVVLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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