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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000307`

染色体: Chr03 坐标: 3493752-3496159 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000307`
名称	SmilChr03G000307
描述	inactive disease susceptibility protein LOV1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3493752 - 3496159 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016978`
GeneID	`131016978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016978`
原始查询	`LOC131016978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inactive disease susceptibility protein LOV1-like
产物	inactive disease susceptibility protein LOV1-like
Arabidopsis	`AT3G50950` (ZAR1) HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824259] identity=40.8; qcov=0.662; evalue=1.17e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057801816.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057801817.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801818.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801817.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801818.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3494257`	`CAG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B121,B138,B43,B82,C18
`Chr3:3494269`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A14,A15,A2,A21,A23,A24,A5,A9,B1,B104,B107,B109,B11,B111,B113,B115,B119,B12,B122,B124,B125,B126,B136,B24,B32,B37,B40,B41,B5,B50,B57,B60,B61,B64,B65,B68,B76,B80,B91,C11,C14,C16,C17,C2,C20,C21,C27,C28,C29,C30,C33,C36,C4,C41,C44,C46,C48,C49,C5,C54,C58,C59,C6,C60,C69,C73,C75,C76,C87
`Chr3:3494270`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	51	A14,A15,A21,A23,A9,B1,B107,B109,B11,B111,B113,B119,B122,B124,B125,B126,B136,B24,B37,B40,B5,B50,B57,B58,B60,B64,B65,B80,C11,C14,C16,C17,C20,C21,C27,C28,C29,C30,C33,C36,C48,C49,C5,C54,C59,C6,C60,C69,C75,C76,C81
`Chr3:3494275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:3495320`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	142	A1,A11,A13,A14,A15,A2,A20,A23,A4,A6,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B104,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B113,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B131,B133,B134,B137,B139,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B25,B29,B30,B31,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B49,B54,B55,B61,B65,B67,B68,B70,B71,B72,B75,B76,B77,B82,B83,B85,B86,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B99,C1,C14,C15,C16,C2,C22,C24,C26,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C41,C42,C43,C44,C48,C49,C50,C53,C59,C62,C63,C64,C66,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr3:3495333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B38,C1,C13,D6
`Chr3:3495348`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A1,B134,B137,B19,B70,C43,C50,C82
`Chr3:3495353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C48
`Chr3:3495353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:3495355`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B49
`Chr3:3495355`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B49
`Chr3:3495359`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801816.1

127 aa

127

Rx_N

PF18052 Rx_N 2-60 aa

XP_057801817.1

90 aa

Rx_N

PF18052 Rx_N 2-60 aa

XP_057801818.1

74 aa

Rx_N

PF18052 Rx_N 2-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801816.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	2	60	4.3e-13	49.9	Rx N-terminal domain
`XP_057801817.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	2	60	2e-13	51.0	Rx N-terminal domain
`XP_057801818.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	2	60	1.7e-13	51.2	Rx N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099286.1
CGATAAACAAAACTCTATAATTGAAAACCCTAGTAAGTAGTGAGTACTGAAGAGAGAGAGGGAGAGCGATGGCGGATGTAGCAGTGGAGTTCCTGCTGAATAACCTCAAGGAGCTACTGCTTTACACTTGAAGCTAATTACCGAGATGAGGAGCCAGATCGAGAACCTGGAGAAGGAATCTCCGCATCTTCAAAGCCTTCTCAAGGACTCCGTGAAGAAGCAGAGAGAGGATGAGCACACGAAGGCACTGGTGCAGAACA...

XM_057945835.1
CGATAAACAAAACTCTATAATTGAAAACCCTAGTAAGTAGTGAGTACTGAAGAGAGAGAGGGAGAGCGATGGCGGATGTAGCAGTGGAGTTCCTGCTGAATAACCTCAAGGAGCTACTGCTTTACACTTGAAGCTAATTACCGAGATGAGGAGCCAGATCGAGAACCTGGAGAAGGAATCTCCGCATCTTCAAAGCCTTCTCAAGGACTCCGTGAAGAAGCAGAGAGAGGATGAGCACACGAAGGCACTGGTGCAGAACA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016978
ATGAGGAGCCAGATCGAGAACCTGGAGAAGGAATCTCCGCATCTTCAAAGCCTTCTCAAGGACTCCGTGAAGAAGCAGAGAGAGGATGAGCACACGAAGGCACTGGTGCAGAACATTCGCGACGTCGTTTATGAGGTGGAAGATGTGGTCGATCTCTTCCTAACCAAGGCTAACCTCAGAATCGATAACGAAGACATATCTGATAAACCTCAGGGTCTTCTTTAA

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057801816.1
MRSQIENLEKESPHLQSLLKDSVKKQREDEHTKALVQNIRDVVYEVEDVVDLFLTKANLRIDNEDISDKPQAWPLRERRGRLRRTIIKQPIQETFYLDVVLLTGMFGLGKMRWRGRFTKPFKKTSLL

XP_057801817.1
MRSQIENLEKESPHLQSLLKDSVKKQREDEHTKALVQNIRDVVYEVEDVVDLFLTKANLRIDNEDISDKPQGLLKKCADLCGHFVSLFLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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