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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001325`

染色体: Chr01 坐标: 26327136-26330135 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001325`
名称	SmilChr01G001325
描述	L-ascorbate oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26327136 - 26330135 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017062`
GeneID	`131017062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017062`
原始查询	`LOC131017062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase-like
产物	L-ascorbate oxidase-like
Arabidopsis	`AT5G21105` (AT5G21105) Plant L-ascorbate oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832235] identity=62.8; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0567200` (OsAAO1) - identity=62.2; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0005576 (extracellular region); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057801837.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057801837.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801837.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801837.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26327361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:26327561`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr1:26327561`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr1:26327801`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A18,A19,A25,A9,B137,B52,C4,C76
`Chr1:26328009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:26328071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr1:26328100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B27,B94
`Chr1:26328101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:26329102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B122,B13,C57
`Chr1:26329165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C26
`Chr1:26329237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B122,B13,C31,C57
`Chr1:26329273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801837.1

576 aa

288

576

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 30-143 aa PF00394 Cu-oxidase 156-322 aa PF07731 Cu-oxidase_2 428-548 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801837.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	30	143	3.8e-43	147.1	Multicopper oxidase
`XP_057801837.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	156	322	1.4e-47	162.4	Multicopper oxidase
`XP_057801837.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	428	548	2.4e-42	144.6	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945854.1
TAATATGTGAAAGCCTTCTCTCTCAGCTTCCCAAACAGAAACTTTTAAATATTTTCATAAATATATATAAAAGATGGGAGTGTTAGTTGATGTGTTTTTGATTTTGGTATATATAATATACACAGCAAAGGCAGGTGAAGCCAAGGATTTGAAATGGGAGGTGGAATACAAGCGGTGGTCTCCAGACGGGAAGGAAAGTGTGGTAATAGCCATCAACGGGAAGTTCCCGGGCCCCACAATACGGGCTCGGGCCGGCGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017062
ATGGGAGTGTTAGTTGATGTGTTTTTGATTTTGGTATATATAATATACACAGCAAAGGCAGGTGAAGCCAAGGATTTGAAATGGGAGGTGGAATACAAGCGGTGGTCTCCAGACGGGAAGGAAAGTGTGGTAATAGCCATCAACGGGAAGTTCCCGGGCCCCACAATACGGGCTCGGGCCGGCGACACCATTAATGTTGAGCTCACCAACAAGCTTCCCACTGAGGGGGTTGTCATCCACTGGCATGGAATCACACAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801837.1
MGVLVDVFLILVYIIYTAKAGEAKDLKWEVEYKRWSPDGKESVVIAINGKFPGPTIRARAGDTINVELTNKLPTEGVVIHWHGITQKGTPWADGTASISQCPINPGESFVYTFKVDKAGTFFYHGHYGMQRSSGLYGMLIVDVAEEQTEKFTYNDEFHILLSDWWHKGAHEQEVDLSSKPMRWIGEPQSLLINGRGQFDCSLAATSSSESAVPCDDLEGGEQYAPHILHVVTGKTYRLRIASSTALASLNFSIGNHKLTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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