当前解析结果
SmilChr01G000484| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000484 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000484 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000484 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 9918819 - 9919442 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017083 |
|---|---|
| GeneID | 131017083 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017083 |
| 原始查询 | LOC131017083 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=38.1; qcov=0.647; evalue=3.45e-21; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017083 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057801847.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057801847.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057801847.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801847.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801847.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:9918844 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:9918857 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B19,B27,C56,C60 |
Chr1:9918858 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,C60 |
Chr1:9918859 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B47,B53,B63,C61 |
Chr1:9918867 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B29,D10,D2,D7 |
Chr1:9918916 |
CTT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 18 | A18,A19,B103,B110,B124,B16,B6,B75,B8,B88,C22,C3,C50,C53,C67,C78,D11,D8 |
Chr1:9918990 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,B16 |
Chr1:9918996 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B110,B124,B16,B6,B8,B88,C22,C67 |
Chr1:9919001 |
C |
CGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B119,B62,C66,C7,C71 |
Chr1:9919001 |
C |
CGA |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | B119,B62,C66,C7,C71 |
Chr1:9919002 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B119,B62,C66,C7,C71 |
Chr1:9919002 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 5 | B119,B62,C66,C7,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。