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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000455`

染色体: Chr03 坐标: 4848360-4849955 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000455`
名称	SmilChr03G000455
描述	cytosolic sulfotransferase 12-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4848360 - 4849955 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017136`
GeneID	`131017136`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017136`
原始查询	`LOC131017136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytosolic sulfotransferase 12-like
产物	cytosolic sulfotransferase 12-like
Arabidopsis	`AT3G45070` (AT3G45070) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823642] identity=46.4; qcov=0.971; evalue=1.58e-112; confidence=high
Rice	`Os04g0526300` - identity=45.3; qcov=0.983; evalue=1.94e-99; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008146 (sulfotransferase activity); GO:0051923 (sulfation)
KEGG	-
Pfam	PF00685 (Sulfotransfer_1); PF13469 (Sulfotransfer_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017136

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801853.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801853.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801853.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801853.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801853.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4848467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B127,B140
`Chr3:4848478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:4848489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D6
`Chr3:4848489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:4848551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B60,C52,C74
`Chr3:4848571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C30
`Chr3:4848571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:4848639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B107,B18,C13,C5
`Chr3:4848698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:4848702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B40,B54,B86
`Chr3:4848714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B23,B31,C39,D11
`Chr3:4848720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B74,B87,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801853.1

346 aa

173

346

Sulfotransfer_1

Sulfotransfer_3

PF00685 Sulfotransfer_1 62-343 aa PF13469 Sulfotransfer_3 176-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801853.1`	Pfam	`PF00685`	Sulfotransfer_1	Domain	62	343	1.5e-73	248.1	Sulfotransferase domain
`XP_057801853.1`	Pfam	`PF13469`	Sulfotransfer_3	Domain	176	268	4.9e-09	37.5	Sulfotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945870.1
ATGCTATATTTCGCCTCTGCTTTGAGGAAGTAATCCCAATTACATATATATAGGCCTCACACATACAAACCTAATGCACAATTAAAAATGTCATCATCTTCAAATTTCTTCAAATCGCCACAACTATCCCAAGACTTCAAAGAGTTCCTCTCCACTCTACCCAAAGAAAATGGACTCGAAAAAGACCCTCTCTACCTCTATCAAGGTTTCTGGTACTTAGACGTCTTTCTTGAAGGTGCAATTTCAATCCAACAACATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017136
ATGTCATCATCTTCAAATTTCTTCAAATCGCCACAACTATCCCAAGACTTCAAAGAGTTCCTCTCCACTCTACCCAAAGAAAATGGACTCGAAAAAGACCCTCTCTACCTCTATCAAGGTTTCTGGTACTTAGACGTCTTTCTTGAAGGTGCAATTTCAATCCAACAACATTTCCAAGCGGAGGATTCCGACGTCTTCGTCGCTTCCACTCCGAAATGCGGCAGCACGTGGTTGAAGGCGATTGCATTCGCCCTACTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801853.1
MSSSSNFFKSPQLSQDFKEFLSTLPKENGLEKDPLYLYQGFWYLDVFLEGAISIQQHFQAEDSDVFVASTPKCGSTWLKAIAFALLNRRRHPTQGRSQAPGMIRQTPDSVPDPTASGDHPLLSTNPHNLVPFLEIGLYGGNKALDIASFPSPRLLATHVPYSSLPKSIRSSGSKCKILYVARNPKDAFVSMWHFLAKARKLDLTMAEAFELFCEGLSVYGPFWDHVLEYWKQSLENPERVLFLKYEDMKARPAVEVRRVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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