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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000459`

染色体: Chr03 坐标: 4902541-4905699 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000459`
名称	SmilChr03G000459
描述	probable disease resistance protein At1g58390
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	4902541 - 4905699 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017140`
GeneID	`131017140`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017140`
原始查询	`LOC131017140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58390
产物	probable disease resistance protein At1g58390
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=29.9; qcov=0.994; evalue=9.15e-52; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=28; qcov=0.824; evalue=8.87e-47; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017140

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057801859.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801859.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801859.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801859.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:4902556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B59,B63,B83
`Chr3:4902556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B63,B83
`Chr3:4902559`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A18,A2,A24,A5,A9,B103,B104,B105,B113,B117,B12,B125,B13,B130,B132,B139,B14,B140,B15,B16,B2,B3,B40,B42,B43,B46,B47,B52,B54,B56,B69,B73,B74,B78,B86,C13,C40,C44,C56,C61,C65,C70,C72,C75,C79,C82,C86,D2,D3,D5,D7
`Chr3:4902566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B130,B140,B40,B54,B69,B86
`Chr3:4902582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A19,B12,B21,B29,B32,B55,B62,B71,B75,B76,B98,C43,C49
`Chr3:4902594`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A18,A2,A24,A5,B103,B104,B105,B117,B12,B125,B13,B132,B139,B14,B16,B2,B3,B42,B43,B46,B47,B52,B56,B68,B73,B74,B78,C13,C40,C44,C56,C61,C65,C70,C72,C75,C79,C86,D2,D3,D5,D7
`Chr3:4902597`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	41	A18,A2,A24,A5,B103,B104,B105,B117,B125,B13,B132,B139,B14,B16,B2,B3,B42,B43,B46,B47,B52,B56,B68,B73,B74,B78,C13,C40,C44,C56,C61,C65,C70,C72,C75,C79,C86,D2,D3,D5,D7
`Chr3:4902639`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B54,B69,B86
`Chr3:4902639`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B54,B69,B86
`Chr3:4902641`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A18,B100,B104,B140,B55,C31,C32,C49,C68,C87,D2,D8
`Chr3:4902644`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A18,B100,B104,C32,C55,C68,C87,D8
`Chr3:4902646`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,B104,C32,C68,C87,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801859.1

655 aa

328

655

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 146-312 aa PF23598 LRR_14 520-624 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801859.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	146	312	1.6e-25	90.4	NB-ARC domain
`XP_057801859.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	520	624	2.9e-16	59.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945876.1
ACTATAATGATGGTCTATGGATGCAGTTGGCCTAATTAAGGTAACAACGAACATGGCAAAGGCCCTCATCTCATGGGTGATACGAAGGCTTGAGAGATCGTTGGTTGAGTTATCGGATTCCTCCGACGGGAAGATAGAAAAAGTAATTCATGAGATGAGAATTATTCTTGATTTCTTGAGAGACAAGAAATTGGGAAAAGGGAGCAGGCTAAATTATTTCATAGCTGACATCGCCGATATGGTTCGCGAAGCCCTCAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017140
ATGGATGCAGTTGGCCTAATTAAGGTAACAACGAACATGGCAAAGGCCCTCATCTCATGGGTGATACGAAGGCTTGAGAGATCGTTGGTTGAGTTATCGGATTCCTCCGACGGGAAGATAGAAAAAGTAATTCATGAGATGAGAATTATTCTTGATTTCTTGAGAGACAAGAAATTGGGAAAAGGGAGCAGGCTAAATTATTTCATAGCTGACATCGCCGATATGGTTCGCGAAGCCCTCAACGTCGAGGATGACTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801859.1
MDAVGLIKVTTNMAKALISWVIRRLERSLVELSDSSDGKIEKVIHEMRIILDFLRDKKLGKGSRLNYFIADIADMVREALNVEDDSSIYAKLHHLETWVGEVKTRVLKYGVDGAENSLEGDDGDDEEGDAVGLEKDVKRLLHRGVFSEEQELQTATIPGMVGIGKMTLARQVYNHAGVKDRFDRRVWVSVASELSHKEVLKKLLQQVVECEELERDLLLKKMEYADNRCLRQMLHQRLQGMRYFIVLDDWPEEMCLKSIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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