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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000491`

染色体: Chr03 坐标: 5263340-5269150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000491`
名称	SmilChr03G000491
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5263340 - 5269150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017165`
GeneID	`131017165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017165`
原始查询	`LOC131017165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.8; qcov=1.02; evalue=6.44e-92; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=27.7; qcov=0.972; evalue=9.08e-75; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801879.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801879.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801879.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801879.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5263584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:5263599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B131,B6,B89,C25
`Chr3:5263635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B60,C62,C74
`Chr3:5263668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B20,B78,C38,C77
`Chr3:5263673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B25
`Chr3:5263700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B42,B43
`Chr3:5263707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B62,B71,B75
`Chr3:5263761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B22,B42,B43
`Chr3:5263812`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	102	A10,A11,A16,A19,A20,A22,A23,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B103,B104,B106,B108,B109,B112,B114,B115,B12,B126,B129,B133,B137,B14,B15,B16,B21,B28,B29,B32,B33,B39,B46,B48,B49,B52,B53,B55,B58,B59,B6,B63,B64,B68,B7,B70,B74,B76,B81,B83,B84,B9,C1,C11,C12,C14,C15,C16,C19,C2,C20,C24,C25,C27,C32,C36,C37,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C49,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C6,C61,C63,C65,C68,C71,C73,C75,C76,C80,C84,C87,D10,D2,D3,D5,D9
`Chr3:5263881`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	138	A1,A10,A11,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B104,B105,B106,B108,B109,B110,B112,B113,B114,B120,B121,B123,B126,B128,B129,B132,B133,B135,B14,B15,B16,B20,B21,B24,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B39,B40,B41,B47,B51,B52,B53,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B68,B69,B7,B71,B72,B75,B76,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B93,B94,B96,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C24,C25,C28,C29,C30,C31,C34,C36,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C51,C52,C55,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C66,C67,C7,C71,C76,C80,C84,C85,C87,D10,D2,D3,D4,D5,D9
`Chr3:5265757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B86,C85
`Chr3:5265825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B19,B49,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801879.1

882 aa

441

882

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

PF18052 Rx_N 5-95 aa PF00931 NB-ARC 153-321 aa PF23559 WHD_DRP 413-483 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801879.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	95	4.5e-19	69.1	Rx N-terminal domain
`XP_057801879.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	153	321	8.7e-41	140.1	NB-ARC domain
`XP_057801879.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	413	483	1e-20	74.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945896.1
ATTGTGGAATGCTACTACTATCTTACACGAGGGATGGAGGGAGTATTATAATAGAAAAAAAAAGGAGACCCTCAATCAAGACAACTTCGAAGTCTGTGGCATCATTTGTCTATGAAAAAACCCATGTCTAATCCCTGCTTCCCAATTTCTGCAAATACATAGACAATATCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCGGACGCTGCAGTGGAGTTCCTGCTGAACAACCTGAAGGATCTCCTTCTCTACCACTCGCATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017165
ATGGCGGACGCTGCAGTGGAGTTCCTGCTGAACAACCTGAAGGATCTCCTTCTCTACCACTCGCATCTCATCACCGACACGAAGAAGCAGATCGAGACTCTGGAGATGGATCTCCGCCTCTTCAACGCGTTCCTCAAGGACTCGCTGAGGAAGCGGCGGAAGGACGAGCGCACGAAGGTGCTGGTGAGGAACATTCGAGATGTTGTGTATGAGGTGGAAGATGTGATCGACGCCTTCATCACTCAGGCCATGGAGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801879.1
MADAAVEFLLNNLKDLLLYHSHLITDTKKQIETLEMDLRLFNAFLKDSLRKRRKDERTKVLVRNIRDVVYEVEDVIDAFITQAMEKKATSSFFKFWKPSVNLHEIGVKVEEVRTKVEKARIDFADLSVHDEDNYGKPEARPPRQKDVVGFADVTEELISRLTQETDYFDVVSLIGMFGLGKTTLAWKIFNDPAIIYKFPVRIWLPISQEFSDKDIFLAILKEFTTVNDDLRQKADMEIARIVAGYLDTASFFIVLDDVWN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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