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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000518`

染色体: Chr03 坐标: 5575585-5578173 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000518`
名称	SmilChr03G000518
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5575585 - 5578173 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017186`
GeneID	`131017186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017186`
原始查询	`LOC131017186`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=29.3; qcov=1.02; evalue=3.18e-49; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=28.7; qcov=1.03; evalue=4.42e-49; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801904.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801904.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801904.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801904.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5576391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr3:5576447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D7
`Chr3:5576545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C71
`Chr3:5576815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:5576840`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B31
`Chr3:5576840`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B31
`Chr3:5576843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,C13,C49,C55
`Chr3:5576908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C32
`Chr3:5576911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:5576913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C60
`Chr3:5576917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C13
`Chr3:5576950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C79,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801904.1

547 aa

274

547

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 107-177 aa PF23598 LRR_14 250-531 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801904.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	107	177	9.9e-17	61.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801904.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	250	531	1.7e-19	70.6	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945921.1
TTCCCAGATCAACAAGATAAAGCAAGTAGATTGTTGGTTACCACCCGCAACAAGATTATCACAAAGTATGATCAATACGTCCACAATATGAGTCTCTTAGACTCCAAAAAAAGCTGGGAATTGTTGTTGAAGAAGGCATTCGTTGGCAACACAATTGGCAATTGTCCAGAAGAATTCGAGGGTGTAGGCACACAAATCTTGCAAAAATGCGATGGTCTACCATTAGCTATCAGCGTGGTAGGAGGCTTACTCATGGTAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017186
ATGAGTCTCTTAGACTCCAAAAAAAGCTGGGAATTGTTGTTGAAGAAGGCATTCGTTGGCAACACAATTGGCAATTGTCCAGAAGAATTCGAGGGTGTAGGCACACAAATCTTGCAAAAATGCGATGGTCTACCATTAGCTATCAGCGTGGTAGGAGGCTTACTCATGGTAACACAAACCAAGAGTGGATGGGAACAAGTTCTTAACCAATTAAACTCTTATTTGGGAAGGACTGAAAGCGGCGTATCAGCAATTTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801904.1
MSLLDSKKSWELLLKKAFVGNTIGNCPEEFEGVGTQILQKCDGLPLAISVVGGLLMVTQTKSGWEQVLNQLNSYLGRTESGVSAILELSYQNLSPQLKSCFLCLAFFKEDFTIPAKRLVNIWNAQGLIQQEGSRSIFDEIGRGYLNELINRSMVQIQDLNIHDQVKSCRLHDLVREVCLRKAKEEIGLEIVKGDGGISSESSYKPRHRVVYAKNLETSSSNQNKHVRSLFLLNVHDDSGYITTPSHYWKGYQLLKTVELD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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