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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000541`

染色体: Chr03 坐标: 5874055-5878153 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000541`
名称	SmilChr03G000541
描述	disease resistance protein RPH8A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5874055 - 5878153 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017201`
GeneID	`131017201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017201`
原始查询	`LOC131017201`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPH8A-like
产物	disease resistance protein RPH8A-like
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=31.1; qcov=1.02; evalue=1.93e-101; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=28.2; qcov=1.02; evalue=1.21e-82; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801919.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801919.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801919.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801919.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5874129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B59,C80,D9
`Chr3:5874135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr3:5874139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:5874156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B48,D6
`Chr3:5874210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B107,B60,B65,C70
`Chr3:5874230`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B57
`Chr3:5874230`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B57
`Chr3:5874234`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B20,C53
`Chr3:5874234`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B20,C53
`Chr3:5874261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B94
`Chr3:5874281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C52,C80
`Chr3:5874328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C16,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801919.1

874 aa

437

874

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 6-90 aa PF00931 NB-ARC 168-345 aa PF23559 WHD_DRP 434-504 aa PF23598 LRR_14 691-853 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801919.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	6	90	5.4e-22	78.4	Rx N-terminal domain
`XP_057801919.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	168	345	7.8e-35	120.7	NB-ARC domain
`XP_057801919.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	434	504	3.1e-16	59.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057801919.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	691	853	1.3e-21	77.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945936.1
ATGGCAGCGGAGGCGGCGATCTCATCTCTGGTCGAACTACTGTGCGATCAGCTCATCCATAAGGTTAAATTCCTGCGAGGCGTCGAGGGAAAGGTGGAGTCGCTGAAAGCCGAGTTCAAGAGGATGCAATCCTTTCTGGAAGACGCCAACAAAAAGCAATTTCAAGACATGAGGGTGCGTAATTGGATCTCGGAGATCAGAGAGTTGGCTCAAGATGCCCAAGATACCATCGAGATGTTCCTTCTCAACGTTGAGAGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017201
ATGGCAGCGGAGGCGGCGATCTCATCTCTGGTCGAACTACTGTGCGATCAGCTCATCCATAAGGTTAAATTCCTGCGAGGCGTCGAGGGAAAGGTGGAGTCGCTGAAAGCCGAGTTCAAGAGGATGCAATCCTTTCTGGAAGACGCCAACAAAAAGCAATTTCAAGACATGAGGGTGCGTAATTGGATCTCGGAGATCAGAGAGTTGGCTCAAGATGCCCAAGATACCATCGAGATGTTCCTTCTCAACGTTGAGAGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801919.1
MAAEAAISSLVELLCDQLIHKVKFLRGVEGKVESLKAEFKRMQSFLEDANKKQFQDMRVRNWISEIRELAQDAQDTIEMFLLNVESAKNWGLFKRCTTFPKRMYHLYGIGDEIESILTRLDAIDKSRERYGIQDLGEAAESSSRSEVELRRRLCNWQKDEHLVGVEDDVKKLLQESILCEEKKGLSITVLEGMGGIGKSTLAREIYNHPDVVAGPFDHRCWVVVSSEFTPQETIKQLILELSGSDKQKVRELEESTKDKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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