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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000554`

染色体: Chr03 坐标: 5998264-6007964 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000554`
名称	SmilChr03G000554
描述	ammonium transporter 1 member 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5998264 - 6007964 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017204`
GeneID	`131017204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017204`
原始查询	`LOC131017204`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ammonium transporter 1 member 2-like
产物	ammonium transporter 1 member 2-like
Arabidopsis	`AT4G13510` (AMT1;1) ammonium transporter 1;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826983] identity=76.7; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0620600` (AMT1) - identity=76.9; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008519 (ammonium channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0072488 (ammonium transmembrane transport); GO:0097272 (ammonium homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00909 (Ammonium_transp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801923.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057801923.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057801923.1`
4	Phagosome	Phagosome	0.40000	`XP_057801923.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057801923.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5998424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:5998590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:5998674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:5998679`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B79
`Chr3:5998679`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B79
`Chr3:6005398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:6006647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:6006710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:6006731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B17
`Chr3:6006791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B93,C65
`Chr3:6006806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B40,C58,C71
`Chr3:6006842`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801923.1

503 aa

252

503

Ammonium_transp

PF00909 Ammonium_transp 51-474 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801923.1`	Pfam	`PF00909`	Ammonium_transp	Family	51	474	1.9e-132	442.5	Ammonium Transporter Family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945940.1
TCCAATAATTCATTTCCACTCCAAAAAAACCACCCTCCCTCCCAAAAGATGGCCGATCCACTGAGCTGCGCCGCCGCCGACCTCCTCCCGCTCCTCGGCTCCGCCGCCAACGCCACGGCGGCGGCGGCCTTCATCTGCGGGCGGTTCGACGCGGTGTCGAGCCGGCTCTCCGAGGCCACCTACGCCATCGACAACACGTACCTCCTCTTCTCGGCGTACCTGGTCTTCGCCATGCAGCTCGGCTTCGCGATGCTCTGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017204
ATGGCCGATCCACTGAGCTGCGCCGCCGCCGACCTCCTCCCGCTCCTCGGCTCCGCCGCCAACGCCACGGCGGCGGCGGCCTTCATCTGCGGGCGGTTCGACGCGGTGTCGAGCCGGCTCTCCGAGGCCACCTACGCCATCGACAACACGTACCTCCTCTTCTCGGCGTACCTGGTCTTCGCCATGCAGCTCGGCTTCGCGATGCTCTGCGCCGGCTCCGTCCGCGCCAAGAACACCATGAACATCATGCTCACCAACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801923.1
MADPLSCAAADLLPLLGSAANATAAAAFICGRFDAVSSRLSEATYAIDNTYLLFSAYLVFAMQLGFAMLCAGSVRAKNTMNIMLTNVLDAAAGGLSYYLFGYAFAFGSPSNAFIGKHLFALRDFPTPTADYSFFLYQWAFAIAAAGITSGSIAERTQFVAYLIYSSFLTGFVYPVVSHWVWSGDGWAGAGKIGGSLLFGSGAIDFAGSGVVHMVGGIAGLWGALIEGPRIGRFDHSGRSVALRGHSASLVVLGTFLLWFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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