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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000549`

染色体: Chr03 坐标: 5951906-5957114 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000549`
名称	SmilChr03G000549
描述	putative disease resistance protein At1g50180
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5951906 - 5957114 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017206`
GeneID	`131017206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017206`
原始查询	`LOC131017206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g50180
产物	putative disease resistance protein At1g50180
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=37.8; qcov=0.956; evalue=3.98e-43; confidence=medium
Rice	`Os06g0158300` (KMK0024M20.32) - identity=26.3; qcov=0.984; evalue=1.74e-27; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801925.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801925.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801925.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801925.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5951976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:5951989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B12,B68,C87,D2
`Chr3:5951989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B68,C87,D2
`Chr3:5951994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:5952003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:5952122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,D7,D9
`Chr3:5952125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr3:5952148`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B129,D4
`Chr3:5952148`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B129,D4
`Chr3:5952149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C21
`Chr3:5952168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B36,D4
`Chr3:5952227`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A18,A20,A21,A22,A3,A5,B109,B115,B118,B124,B134,B140,B2,B21,B22,B24,B35,B37,B48,B49,B52,B59,B62,B7,B78,B79,B82,B87,B88,C27,C33,C34,C35,C44,C59,C63,C71,C77,C8,C82,C9,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801925.1

321 aa

160

321

Rx_N

NB-ARC

PF18052 Rx_N 7-90 aa PF00931 NB-ARC 164-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801925.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	7	90	1.1e-21	77.5	Rx N-terminal domain
`XP_057801925.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	164	301	6.5e-26	91.7	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945942.1
AAAAAAAAAGTTAGAGGTCGATCGAGATGGCAGCGGAGGCGGCAATCTTATCTTTGGTGGATCTACTGGGCAATCAGCTCATCCAGAAGGTGAAATTCATGCGAGGCGTTAAGAGAAATGTGGAGTTGCTGAGAGACGAGCTGAGGAGGATGCAATCCTTTCTCAAAGACGCCAACAAAAAGCAATTTGAAGACGAGAGCGTGCGTAATTGGATCTCGGGTATCAGAGAGTTGGCTCAAGATGCCCAAGATACCATTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017206
ATGGCAGCGGAGGCGGCAATCTTATCTTTGGTGGATCTACTGGGCAATCAGCTCATCCAGAAGGTGAAATTCATGCGAGGCGTTAAGAGAAATGTGGAGTTGCTGAGAGACGAGCTGAGGAGGATGCAATCCTTTCTCAAAGACGCCAACAAAAAGCAATTTGAAGACGAGAGCGTGCGTAATTGGATCTCGGGTATCAGAGAGTTGGCTCAAGATGCCCAAGATACCATTGAGATCTTCCTTCTCGACGTTGAGAGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801925.1
MAAEAAILSLVDLLGNQLIQKVKFMRGVKRNVELLRDELRRMQSFLKDANKKQFEDESVRNWISGIRELAQDAQDTIEIFLLDVESAKNWGFIKRCTSYLKHMHIGDEIESIRARLDAIDKSRETYGIKDLGEATESSSRSEVESRRRLIPWQKDEHLVGVKDDVEKLLHESILCEEKKGLSITVLEGMGGIGKSTLAREIYNHPKVVAGPFDRRGWVVVSSEFTPQETIKQLILELPGSRNKKVHELEESTKDKQYLLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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