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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000553`

染色体: Chr03 坐标: 5988128-5991376 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000553`
名称	SmilChr03G000553
描述	uncharacterized SmilChr03G000553
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	5988128 - 5991376 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017207`
GeneID	`131017207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017207`
原始查询	`LOC131017207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOW protein: ammonium transporter 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833710]; symbol=AT5G37360; hit=AT5G37360; species=arabidopsis; confidence=high
产物	LOW protein: ammonium transporter 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833710]; symbol=AT5G37360; hit=AT5G37360; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G37360` (AT5G37360) LOW protein: ammonium transporter 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833710] identity=59.9; qcov=0.928; evalue=4.97e-107; confidence=high
Rice	`Os02g0815400` - identity=55.6; qcov=0.822; evalue=1.18e-92; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11282 (DUF3082)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801926.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057801926.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057801926.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057801926.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801926.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:5988246`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr3:5988246`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91
`Chr3:5988264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr3:5988329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B11,B19
`Chr3:5988418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:5988576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B117,B31
`Chr3:5989827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B40,C58,C71
`Chr3:5989931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:5990064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B9,C22,C26
`Chr3:5990085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B11,B123,B19
`Chr3:5990670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:5990844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B11,B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801926.1

304 aa

152

304

DUF3082

PF11282 DUF3082 223-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801926.1`	Pfam	`PF11282`	DUF3082	Family	223	299	1.1e-05	26.3	Protein of unknown function (DUF3082)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945943.1
ACATTAAATCCACCTGTCAACTCCAAAACCAGAAAAATAAATAAATAAATGTAGAAAAAGATAACTGATTAACAAGAAAAAACTGCAACACCGTTTCTTGCTTAGAAACCAAAAAAAATGGCTACTACCTCACTTTCAGCTTTCAATCTTCTTCCTCCCTCCAAATTCTCTTCATCTCATGCCCACTCCTTCCCCCAAATTCCCCTCCACATCCCCTCCTTCCCAAATTGCAGAGCCCTAAAGTCCAAATCCCTTAGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017207
ATGGCTACTACCTCACTTTCAGCTTTCAATCTTCTTCCTCCCTCCAAATTCTCTTCATCTCATGCCCACTCCTTCCCCCAAATTCCCCTCCACATCCCCTCCTTCCCAAATTGCAGAGCCCTAAAGTCCAAATCCCTTAGAACAATTTCATTTGCTCTTGCGGAATCATCGGACTCCTCCAAATCCCTAGACCCTGATCCCAAAATTCTTCTCCAGGAAGTCGCGGATTGTTTTGTTCTTCCCGCAGACTTTTTCAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801926.1
MATTSLSAFNLLPPSKFSSSHAHSFPQIPLHIPSFPNCRALKSKSLRTISFALAESSDSSKSLDPDPKILLQEVADCFVLPADFFKQLPNDLRLDLNDAAFDLSNGTVKDECGEEAGETLLDISRAWENAETSTSAALMSKLPQLVGSLTSKNKSALGKRMVSASRRFQAMGQYGQGELQMIAKVMNRVGKVLSETPVSEAANEEPKQETKVLKFGDLQVELTPEKAYVGAVIAFFFGILSWQVSQGVQRIPESSLEYAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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