当前解析结果
SmilChr03G000600| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000600 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000600 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000600 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 6671597 - 6674356 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017251 |
|---|---|
| GeneID | 131017251 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017251 |
| 原始查询 | LOC131017251 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0625200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0625200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0625200- identity=30.3; qcov=0.505; evalue=1.16e-18; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017251 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801972.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801972.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801972.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801972.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057801972.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:6671926 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A10,B105,B127,B139,B29,B83,B90,C15,C80,D5 |
Chr3:6672164 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B67,C63 |
Chr3:6672193 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B105 |
Chr3:6672193 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr3:6672234 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C63,C74,C87 |
Chr3:6672237 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C38,C54 |
Chr3:6672244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr3:6672294 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B125,B75,C33,C39,C41 |
Chr3:6672466 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr3:6672614 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B2,B85,C37,C54 |
Chr3:6672631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B30,C25,C52,C59 |
Chr3:6672633 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B48,B71,B95,B99 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。