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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000486`

染色体: Chr01 坐标: 9932910-9934484 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000486`
名称	SmilChr01G000486
描述	uncharacterized SmilChr01G000486
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9932910 - 9934484 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017278`
GeneID	`131017278`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017278`
原始查询	`LOC131017278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=40; qcov=0.343; evalue=5.88e-10; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=51.3; qcov=0.926; evalue=6.2e-70; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017278

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802007.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802007.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802007.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802007.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9932916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B15,B30
`Chr1:9932946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:9933008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr1:9933011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:9933016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C60
`Chr1:9933029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:9933078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B130
`Chr1:9933078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:9933110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:9933111`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr1:9933111`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr1:9933151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802007.1

204 aa

102

204

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 46-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802007.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	46	192	3.6e-59	200.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946024.1
ATGCTGGTTGTTATTTGTATGCTAGCAAATGGTGGAGCAGCTGACCAGTACGACAAGTACCTACGGATTGCAGAGTCTACTTCGTTGGATTGCATGCGCCGCTTCTGTGCGGTGGTCATCCAATGCTTCGGCACAGAGTACTTGAGGAGACCAACCCCTGCCGACTGCCAAAGGCTCATGGCAATGCACGAGGTGAAACACGACTTCCCAAGAATGTTTGGAAGTCTTGATTGCATGCATTGGGCGTGGAAGAATTGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017278
ATGCTGGTTGTTATTTGTATGCTAGCAAATGGTGGAGCAGCTGACCAGTACGACAAGTACCTACGGATTGCAGAGTCTACTTCGTTGGATTGCATGCGCCGCTTCTGTGCGGTGGTCATCCAATGCTTCGGCACAGAGTACTTGAGGAGACCAACCCCTGCCGACTGCCAAAGGCTCATGGCAATGCACGAGGTGAAACACGACTTCCCAAGAATGTTTGGAAGTCTTGATTGCATGCATTGGGCGTGGAAGAATTGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802007.1
MLVVICMLANGGAADQYDKYLRIAESTSLDCMRRFCAVVIQCFGTEYLRRPTPADCQRLMAMHEVKHDFPRMFGSLDCMHWAWKNCPVAWHEAYTRGDQEEPTITLEAVVSQDLWIWHAFFGIPGANNDINVLNSSTLFHDQLEEKAPPVTFQVNNSFYQKGYYLTDCIYSNWPMFVKSPTHPTDEKSKRFKSALVTEISFVEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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