当前解析结果
SmilChr03G000667| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000667 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000667 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000667 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 7470144 - 7471001 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017285 |
|---|---|
| GeneID | 131017285 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017285 |
| 原始查询 | LOC131017285 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017285 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801994.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057801994.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057801994.1 |
| 4 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057801994.1 |
| 5 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057801994.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:7470286 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr3:7470295 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C21 |
Chr3:7470299 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C35,C6 |
Chr3:7470318 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C11 |
Chr3:7470325 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B104 |
Chr3:7470325 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:7470356 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B122,B128,B16,B64,B71,B89,B93,C4,C58 |
Chr3:7470379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr3:7470421 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B123 |
Chr3:7470477 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B97 |
Chr3:7470634 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B58,B60,C52,C74 |
Chr3:7470777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,C59 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。