当前解析结果
SmilChr03G000679| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000679 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000679 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000679 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 7566706 - 7568274 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017286 |
|---|---|
| GeneID | 131017286 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017286 |
| 原始查询 | LOC131017286 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017286 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057801995.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057801995.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057801995.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801995.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801995.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:7566812 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,B45,C76 |
Chr3:7566825 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B121,B2,B38,B40 |
Chr3:7566825 |
A |
AC |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B121,B2,B38,B40 |
Chr3:7566842 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C16,D4 |
Chr3:7566847 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:7566857 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,D1 |
Chr3:7566878 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:7566898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C22,C40 |
Chr3:7566902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C30,C65,D5 |
Chr3:7566939 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B125,B25,B90,C73 |
Chr3:7566988 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr3:7567096 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C22,C40,C65,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。