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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001344`

染色体: Chr01 坐标: 26701304-26704417 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001344`
名称	SmilChr01G001344
描述	splicing factor U2af large subunit A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26701304 - 26704417 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017314`
GeneID	`131017314`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017314`
原始查询	`LOC131017314`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	splicing factor U2af large subunit A-like
产物	splicing factor U2af large subunit A-like
Arabidopsis	`AT4G36690` (ATU2AF65A) U2 snRNP auxilliary factor, large subunit, splicing factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829822] identity=78.8; qcov=0.532; evalue=1.31e-78; confidence=medium
Rice	`Os11g0636900` (U2AF65A) - identity=73.2; qcov=0.509; evalue=4.54e-67; confidence=medium
GO	GO:0000243 (commitment complex); GO:0008187 (poly-pyrimidine tract binding); GO:0016607 (nuclear speck); GO:0030628 (pre-mRNA 3'-splice site binding); GO:0071004 (U2-type prespliceosome); GO:0089701 (U2AF complex)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017314

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802010.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802010.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057802010.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802010.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26702049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:26702091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr1:26702312`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C25
`Chr1:26702312`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C25
`Chr1:26702323`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A2,A5,B100,B108,B115,B124,B13,B17,B19,B20,B35,B51,B68,B73,B79,B89,B98,B99,C1,C14,C38,C57,C65,C68,C75,C87,C9,D4,D6,D7,D9
`Chr1:26702332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:26702445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:26703055`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A2,A5,B10,B109,B128,B13,B19,B2,B35,B68,B73,B89,B91,B98,C36,C38,C48,C57,C87,D6
`Chr1:26703170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C40,C71
`Chr1:26703739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:26704178`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A6,B57
`Chr1:26704178`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A6,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946027.1
ATAGACATAAGCTCTATTATAATTTTTAAAAGAATCCTATTCTATTCCTATTAGAATTCTTACTATTTTAGTCTATAAATACATCTAAAATCTCATTGTAAACATATAAGCATACACGAATTCTTGCCATCAATACAAAATTCCCTAAGTTTGGCGTCATTCTTGCGTAGGCACAACAAATTTGATTGCAGTTTGGAGATGGCAACGACTCAGCAGGTTACCAGACATGCTCTCAGGGTCTATGTTGGCGGACTTCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017314
ATGGCAACGACTCAGCAGGTTACCAGACATGCTCTCAGGGTCTATGTTGGCGGACTTCCACCAACTGCTAATCAACAGTCTTTGGCAACATTCTTCAGTCATGTTATGTCAGCAATCGGAGGAAATACTGCCGGTCCAGGAGATGCCGTTGTGAATGTTTACATTAACCATGAGAAGAAATTTGCTTTTGTGGCGATGAGATCAGTTGAGGAGGCTAGCAATGCAATGGCTTTAGATGGCATTATTTTTGAGGGTGCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802010.1
MATTQQVTRHALRVYVGGLPPTANQQSLATFFSHVMSAIGGNTAGPGDAVVNVYINHEKKFAFVAMRSVEEASNAMALDGIIFEGAPVNVRRPSEYNPSLAATLGPTQPNTNLNLAAVGLTSGSALLPNTAAAVAGLLPGVAPTLPGMFPNILPLPGGQFGALPAMPMHAMIQQAARQALRVYVGGLPPTANEQSVATFFNHVMSAIGGNTAGPGDAVVNVYINHEKKFAFVEMRSVEEASNAMALDGIIFEGAAVKVRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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