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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000717`

染色体: Chr03 坐标: 7959538-7962296 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000717`
名称	SmilChr03G000717
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7959538 - 7962296 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017341`
GeneID	`131017341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017341`
原始查询	`LOC131017341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT3G50140` (AT3G50140) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824176] identity=25.8; qcov=1.04; evalue=1.13e-32; confidence=low
Rice	`Os04g0505400` - identity=26.6; qcov=0.974; evalue=7.07e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802045.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802045.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802045.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802045.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7959631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B37,B64,C24,C42
`Chr3:7959633`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A13,B106,B11,B118,B121,B127,B29,B34,B38,B39,B52,B61,B71,B72,B86,B90,B92,B98,C11,C29,C36,C37,C39,C45,C51,C53,C55,C65,C69,C70,C79,C80,C87,D8
`Chr3:7959664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:7959671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B64,C24,C42
`Chr3:7959700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:7959738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B110,B30,B80
`Chr3:7959743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:7959753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B64,C24,C42
`Chr3:7959904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:7959923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:7959974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:7959990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C55,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802045.1

463 aa

232

463

DUF247

PF03140 DUF247 7-447 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802045.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	7	447	2e-81	275.1	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946062.1
AGTATGTATCAATGGCTGCGACACAGAAAATTCAGAAAGTGCAGCCTCTCTTAGTCCGATTGGAGAAGAACAAAAATGACTACTTTCCGCAGGCGGTCTCCTTCGGTCCGTACCACCACGGCGAACCGGAGCTCGCTTTCTTCGAGGCCTTGAAGCCGAAGGCCGTCGAGTTGTTCATATCAGGCGGCCCAGAAGGATACGATGAGTCGTTCTACCACAAAAAAATTGTTGGCATCATCGGTGAAATACGAGACTGCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017341
ATGGCTGCGACACAGAAAATTCAGAAAGTGCAGCCTCTCTTAGTCCGATTGGAGAAGAACAAAAATGACTACTTTCCGCAGGCGGTCTCCTTCGGTCCGTACCACCACGGCGAACCGGAGCTCGCTTTCTTCGAGGCCTTGAAGCCGAAGGCCGTCGAGTTGTTCATATCAGGCGGCCCAGAAGGATACGATGAGTCGTTCTACCACAAAAAAATTGTTGGCATCATCGGTGAAATACGAGACTGCTACGACGAAACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802045.1
MAATQKIQKVQPLLVRLEKNKNDYFPQAVSFGPYHHGEPELAFFEALKPKAVELFISGGPEGYDESFYHKKIVGIIGEIRDCYDETTIGNDELAAMMLRDASLMIIFMEMYIDGNAEQPDETTMDKIRGIVDLFGILPMTILWRDLFLLQNQIPLVVVEVLMDLRCGEGEGEYQNLLNRFLNMSIFGEYSKKRKLSRKPQHLLEAVHMLLVFDFKDESGDAPTCCKLPKVKKADLENGGAETKTTHSHGIIHRLLNSWAC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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