当前解析结果
SmilChr03G000718| 统一新 Gene ID | SmilChr03G000718 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G000718 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G000718 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 7974992 - 7975785 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017343 |
|---|---|
| GeneID | 131017343 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017343 |
| 原始查询 | LOC131017343 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017343 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057802047.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057802047.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057802047.1 |
| 4 | Lipid droplet | 脂滴 | 0.20000 | XP_057802047.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057802047.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:7975244 |
AAT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 96 | A1,A14,A18,A25,A3,A4,A7,A8,B1,B10,B103,B104,B105,B110,B113,B115,B117,B123,B126,B128,B129,B130,B131,B133,B138,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B30,B32,B36,B40,B48,B49,B5,B53,B6,B63,B68,B74,B78,B79,B80,B83,B87,B9,B97,B98,C10,C11,C13,C14,C18,C21,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C35,C4,C40,C44,C45,C5,C50,C51,C55,C59,C6,C60,C62,C65,C66,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C83,C9,D1,D2,D5,D6,D8,D9 |
Chr3:7975250 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 96 | A1,A14,A18,A25,A3,A4,A7,A8,B1,B10,B103,B104,B105,B110,B113,B115,B117,B123,B126,B128,B129,B130,B131,B133,B138,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B30,B32,B36,B40,B48,B49,B5,B53,B6,B63,B68,B74,B78,B79,B80,B83,B87,B9,B97,B98,C10,C11,C13,C14,C18,C21,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C35,C4,C40,C44,C45,C5,C50,C51,C55,C59,C6,C60,C62,C65,C66,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C83,C9,D1,D2,D5,D6,D8,D9 |
Chr3:7975462 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A7,C87 |
Chr3:7975462 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | A7,C87 |
Chr3:7975494 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 43 | A18,A20,A25,A4,A7,B103,B111,B12,B128,B129,B130,B140,B19,B26,B32,B36,B53,B55,B59,B62,B69,B76,B80,B98,C11,C12,C13,C25,C27,C28,C31,C51,C55,C57,C6,C60,C69,C71,C72,C86,C87,D5,D8 |
Chr3:7975495 |
A |
AAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A8,B1,B25,B30,B48,C27,C59,C62,C7,C83,D1 |
Chr3:7975498 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 26 | A25,A4,A7,B103,B111,B12,B128,B129,B130,B140,B19,B32,B36,B53,B59,B98,C12,C13,C25,C31,C6,C71,C72,C87,D5,D8 |
Chr3:7975503 |
CTG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 45 | A10,A13,A8,A9,B1,B11,B118,B119,B124,B139,B14,B22,B24,B25,B26,B29,B30,B46,B48,B51,B55,B60,B62,B67,B69,B72,B76,B82,B85,B86,C17,C21,C23,C36,C39,C4,C40,C46,C59,C74,C83,C86,C87,D3,D8 |
Chr3:7975514 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A18,C14,C27,C51,C60,D1 |
Chr3:7975520 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A25,A4,A7,B103,B111,B12,B128,B129,B130,B140,B19,B22,B32,B36,B53,B59,B6,B9,B98,C12,C13,C25,C31,C6,C71,C72,C87,D5,D8,D9 |
Chr3:7975532 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A18,B80,C14,C27,C47,C51,C60,C69,D1 |
Chr3:7975536 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A18,B80,C10,C14,C27,C47,C51,C60,C69,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。