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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001346`

染色体: Chr01 坐标: 26722310-26731562 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001346`
名称	SmilChr01G001346
描述	la-related protein 1A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26722310 - 26731562 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017344`
GeneID	`131017344`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017344`
原始查询	`LOC131017344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 1A
产物	la-related protein 1A
Arabidopsis	`AT5G21160` (LARP1a) LA RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832242] identity=51.5; qcov=0.735; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0266000` - identity=38.2; qcov=0.987; evalue=1.39e-147; confidence=medium
GO	GO:0000339 (RNA cap binding); GO:0048255 (mRNA stabilization)
KEGG	-
Pfam	PF05383 (La); PF21071 (LARP1_HEAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017344

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802049.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057802049.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057802049.1`
4	P-body	P-body	0.80000	`XP_057802049.1`
5	Stress granule	Stress granule	0.20000	`XP_057802049.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26722622`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A11
`Chr1:26722622`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A11
`Chr1:26722755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B12
`Chr1:26724351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B42,B43
`Chr1:26724637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B112,C22,C3,D8
`Chr1:26724657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:26724989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C56,C60
`Chr1:26726165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C49,C7
`Chr1:26726210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B12
`Chr1:26726332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:26726456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,B95
`Chr1:26726491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802049.1

882 aa

441

882

LARP1_HEAT

PF05383 La 302-357 aa PF21071 LARP1_HEAT 717-865 aa

XP_057802054.1

859 aa

430

859

LARP1_HEAT

PF05383 La 302-357 aa PF21071 LARP1_HEAT 694-842 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802049.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	302	357	5.6e-24	84.5	La domain
`XP_057802049.1`	Pfam	`PF21071`	LARP1_HEAT	Repeat	717	865	6.5e-61	205.5	LARP1 HEAT repeat region
`XP_057802054.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	302	357	5.5e-24	84.5	La domain
`XP_057802054.1`	Pfam	`PF21071`	LARP1_HEAT	Repeat	694	842	6.3e-61	205.6	LARP1 HEAT repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946066.1
AAGTAAGCGCAGCCACGCGCACTCACTCGCAGTCAATCTGTCAACACAACTCTATCAAAAAAGACATTGTAACCCTAGTCTCTCTCTCTCTCTACACGCGCGCGCACGCCCTGCCGCCACCTCTCTCCGCCGCCACACACCAAATCACTTCCATTTTTAGCTCGGTGTTTTTGCCTAAATTCGTCTCGAATTATACACCAATTGAGTAGCCCGCATAACCTTGCTTGTTGATTCCCAGGTATGGGGATGGGAGAGAGTGA...

XM_057946071.1
GCCACGCGCACTCACTCGCAGTCAATCTGTCAACACAACTCTATCAAAAAAGACATTGTAACCCTAGTCTCTCTCTCTCTCTACACGCGCGCGCACGCCCTGCCGCCACCTCTCTCCGCCGCCACACACCAAATCACTTCCATTTTTAGCTCGGTGTTTTTGCCTAAATTCGTCTCGAATTATACACCAATTGAGTAGCCCGCATAACCTTGCTTGTTGATTCCCAGGTATGGGGATGGGAGAGAGTGATGATATTGGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017344
ATGGGGATGGGAGAGAGTGATGATATTGGTGATCAGTTCGATAGCCAAAACGACGTCGTTGTCGGTGCGCCCCCCAAGTCGCCGTGGAAGAAGCCCGCCGCCGTTTCTCCGGCGGCCTCTGATTCGGAGTCATGGCCCGCGCTTGGCGACGCGCAACAGCGGCCGAAGAGCAATGTGGTTGTCGATTTCAACTCCGCCAAGTCCCCGCCAGCTCAACCACATGACCCTCCGGCGATGCAGCCGGCTCCGGAGCAGCAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802049.1
MGMGESDDIGDQFDSQNDVVVGAPPKSPWKKPAAVSPAASDSESWPALGDAQQRPKSNVVVDFNSAKSPPAQPHDPPAMQPAPEQQKFHGRGNIRSPRKPIYQHKTGPKHHGPNVAAPFPVPLPYYPPAFHTMVPMPPNSAPGYPYPFPPGAFPRVDGRLVKPGGDATSKPFVPPANGEFQSPLHANSNAHDSNSVERKPNVKEQDGQMNPSWNNQRPAAFNNNFHLQQTMGSRAFIRPPFLVPAGFIEGANFQGPPGTV...

XP_057802054.1
MGMGESDDIGDQFDSQNDVVVGAPPKSPWKKPAAVSPAASDSESWPALGDAQQRPKSNVVVDFNSAKSPPAQPHDPPAMQPAPEQQKFHGRGNIRSPRKPIYQHKTGPKHHGPNVAAPFPVPLPYYPPAFHTMVPMPPNSAPGYPYPFPPGAFPRVDGRLVKPGGDATSKPFVPPANGEFQSPLHANSNAHDSNSVERKPNVKEQDGQMNPSWNNQRPAAFNNNFHLQQTMGSRAFIRPPFLVPAGFIEGANFQGPPGTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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