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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000746`

染色体: Chr03 坐标: 8525452-8531178 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000746`
名称	SmilChr03G000746
描述	uncharacterized SmilChr03G000746
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8525452 - 8531178 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017367`
GeneID	`131017367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017367`
原始查询	`LOC131017367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=35.6; qcov=0.732; evalue=8.76e-165; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802080.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057802080.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802080.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802080.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8526027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B68,C14,C48
`Chr3:8526038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:8526063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B77,B90,C20
`Chr3:8526082`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,D3
`Chr3:8526082`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B131,D3
`Chr3:8526197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C8
`Chr3:8526220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C20
`Chr3:8526307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C20
`Chr3:8526421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:8526437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:8526645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:8526653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C30,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802080.1

1126 aa

563

1126

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF13963 Transpos_assoc 5-84 aa PF02992 Transposase_21 293-504 aa PF13960 DUF4218 690-803 aa PF13952 DUF4216 972-1046 aa

XP_057802081.1

1126 aa

563

1126

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF13963 Transpos_assoc 5-84 aa PF02992 Transposase_21 293-504 aa PF13960 DUF4218 690-803 aa PF13952 DUF4216 972-1046 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802080.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	84	1.3e-20	74.0	Transposase-associated domain
`XP_057802080.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	293	504	1.6e-82	276.6	Transposase family tnp2
`XP_057802080.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	690	803	2.1e-45	153.9	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057802080.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	972	1046	2.2e-18	67.2	Domain of unknown function (DUF4216)
`XP_057802081.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	84	1.3e-20	74.0	Transposase-associated domain
`XP_057802081.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	293	504	1.6e-82	276.6	Transposase family tnp2
`XP_057802081.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	690	803	2.1e-45	153.9	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057802081.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	972	1046	2.2e-18	67.2	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099570.1
GTTTAGTTCTCATCTGCTCTAATTCGCAAATTTCTCCAAAATCCCCAAATCGCGCCGCCTCCGGTTTGAATACCGCCGCCCGTCACCGCTCCTCTGCCGGTGAGCACGCCGCCGCCTGAAACCCGTTGGCCGGCCGTTCCTCCTGCAGCTTCGCCGCCGTCGCCTGCAACCCCTCTGCCGGCCGAACCTCCTCCAGCTTCTCCATCCGTACGCCACAGTAGCAATTCCCTCCGCCGCAGCAGCAATTCTCCTTATTCCCT...

XM_057946098.1
CCCCGTCCTTTGGTTTAGTTCTCATCTGCTCTAATTCGCAAATTTCTCCAAAATCCCCAAATCGCGCCGCCTCCGGTTTGAATACCGCCGCCCGTCACCGCTCCTCTGCCGGTGAGCACGCCGCCGCCTGAAACCCGTTGGCCGGCCGTTCCTCCTGCAGCTTCGCCGCCGTCGCCTGCAACCCCTCTGCCGGCCGAACCTCCTCCAGCTTCTCCATCCGTACGCCACAGTAGCAATTCCCTCCGCCGCAGCAGCAATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017367
ATGAGTGAAAATCGTGAGTGGATGTATAGACGGTTTTTACCCGACGGAGCTTTCAACCCAGCATTCGTTAGAGGTCTTCAAGAATTCATTGATTTTGCTAACAGTAGAGAAGATTTAATGGATGGACATAAAATTAGATGTCCGTGCAGAAGATGTGATAATATAAAATTTCATACATCGCGGAATGTCCAATACCATATTTCAAAGAATGGGTTTGTGTTGAATTATCACATTTGGAGGTTTCATGGTGAATTAGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802080.1
MSENREWMYRRFLPDGAFNPAFVRGLQEFIDFANSREDLMDGHKIRCPCRRCDNIKFHTSRNVQYHISKNGFVLNYHIWRFHGELEMMATEYNQFDAADDDDNEDDQSTYHNMVIDVAASQVNIEQPPNPEAQQLYDMLSAADRELWPGCNTHSQLSFVARLMCLKAEGNMSERCFDQWLELIKEILPEHNLAPNNFYSTKKLLSGMGLPVEKIDCCRNNCMLFWGEDSEDIECKHCNEPRYQQSDTSSASSSRTLVAVK...

XP_057802081.1
MSENREWMYRRFLPDGAFNPAFVRGLQEFIDFANSREDLMDGHKIRCPCRRCDNIKFHTSRNVQYHISKNGFVLNYHIWRFHGELEMMATEYNQFDAADDDDNEDDQSTYHNMVIDVAASQVNIEQPPNPEAQQLYDMLSAADRELWPGCNTHSQLSFVARLMCLKAEGNMSERCFDQWLELIKEILPEHNLAPNNFYSTKKLLSGMGLPVEKIDCCRNNCMLFWGEDSEDIECKHCNEPRYQQSDTSSASSSRTLVAVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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