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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000768`

染色体: Chr03 坐标: 8780555-8786835 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000768`
名称	SmilChr03G000768
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8780555 - 8786835 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017386`
GeneID	`131017386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017386`
原始查询	`LOC131017386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 2
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 2
Arabidopsis	`AT3G46710` (AT3G46710) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823824] identity=35.1; qcov=0.623; evalue=6.82e-22; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=34.3; qcov=0.677; evalue=1.89e-20; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802106.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802106.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802106.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802106.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802106.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8781515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:8781521`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	68	A10,A18,A21,A25,A4,B100,B102,B105,B115,B117,B119,B120,B121,B129,B130,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B19,B2,B20,B22,B25,B3,B31,B32,B34,B45,B47,B50,B52,B54,B56,B59,B61,B62,B64,B66,B67,B69,B78,B79,B82,B86,B87,B96,C25,C29,C32,C37,C38,C40,C44,C45,C50,C54,C55,C56,C68,C7,C71,D1,D5,D7,D8
`Chr3:8781542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C36,C45
`Chr3:8781582`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr3:8781582`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr3:8781600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B80,C58,C69,C81
`Chr3:8781612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B112,C59
`Chr3:8781646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:8781648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C58,C69
`Chr3:8781785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr3:8781806`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A3
`Chr3:8781806`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802106.1

297 aa

148

297

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 131-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802106.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	131	291	2.3e-30	106.2	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946123.1
TTTTATGTGTGAAACAATAAGTCAACACTTGAACTCGCTCGACTATCTTAGCTGGTGATCTTATTATTTTATTAGTGGTTGTTAAATATGCACATATTGATTGTTTGGCTTCTTCAACTGGGCATTCAATATTATTAATCACAGCTTTCTAACATTATTCTAAACGGAATTCACTATTCCGCCGCGCCGCCCCCAGCCGTTGCTCGCCACCGCTCCTTCGCTGCTCGCTTGGCGCCACCACCTCCTTCCGTCCTTGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017386
ATGTCGGAGGCCCTCCTCTTATTGGTGATACAGAAGCTCGACATCAATTATCGAGAGGACGAAAAAAATGAGAATATGGAAAGGGTAATCAAAGAGATGAAAGAGATTTTTGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGAGGGGAGAACCCTAAATTTTTTAGTATCTGACCTAGTCCAAATGGCTGATGATGCCCTCCACAACTACAACATCAACATCAGATCATTTGGGTCCATTCATAGTTGGATCGGAGAGATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802106.1
MSEALLLLVIQKLDINYREDEKNENMERVIKEMKEIFDIVRDKKLEEGRTLNFLVSDLVQMADDALHNYNINIRSFGSIHSWIGEIKKQMLKLGDDEFNIISISENVDDDKYVVGLDEDLEMLLHKRIIDEEEYLSTVLIKGMCGIGKTTLAREIYNHPTVVKRFERRAWVSNSTHFTLKKLLIKLIQQVEDPQNLHTSSLLEEMDNRRLRYMLCQHLQGKRYLIVLDDVPKQMHLMSFLEALPQEWNGSRLLLTSHTTH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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