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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000776`

染色体: Chr03 坐标: 8840478-8843244 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000776`
名称	SmilChr03G000776
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	8840478 - 8843244 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017393`
GeneID	`131017393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017393`
原始查询	`LOC131017393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.9; qcov=1.11; evalue=4.34e-61; confidence=low
Rice	`Os10g0358200` - identity=25.9; qcov=1.06; evalue=1.39e-51; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802113.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802113.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802113.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802113.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:8840764`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B119,B125,B45,B83,B97,C59,C76
`Chr3:8840823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:8840833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:8840838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B60,C52,C74
`Chr3:8840846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A11,B50,B60
`Chr3:8840846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B50,B60
`Chr3:8840858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,C20,C6,C75
`Chr3:8840868`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A18,A21,B119,B63,C9
`Chr3:8840868`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A18,A21,B119,B63,C9
`Chr3:8840872`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A18,A21,B119,B63,C9
`Chr3:8840872`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A18,A21,B119,B63,C9
`Chr3:8840873`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A1,A3,B101,B131,B33,B40,B59,B99,C14,C4,C44,C60,C67,C81,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802113.1

790 aa

395

790

NB-ARC

AAA_22

LRR_14

PF00931 NB-ARC 137-298 aa PF13401 AAA_22 143-238 aa PF23598 LRR_14 512-781 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802113.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	137	298	1.3e-28	100.5	NB-ARC domain
`XP_057802113.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	143	238	7.6e-08	33.4	AAA domain
`XP_057802113.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	512	781	9e-32	110.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946130.1
GCAAAAAAGCTAAAAGGAAGCAAAGGCATGGCGGAGGGCCTCCTCTTATCGGTGATGCACAAGCTGGATATGAATTATCAAAAGGACACAAAAACAAAGGAAGACATAAAAGAGCAAATGGAGATGGTAATCAAAGAGATGAGAGAGATTGTGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGAGGGGAAAACCCTCAATTTTATGGTATCTGACCTTGTCGACGTGGCTGAGGATGCCGTCGACATTTTCAAACAAAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017393
ATGGCGGAGGGCCTCCTCTTATCGGTGATGCACAAGCTGGATATGAATTATCAAAAGGACACAAAAACAAAGGAAGACATAAAAGAGCAAATGGAGATGGTAATCAAAGAGATGAGAGAGATTGTGGATATTGTGAGGGATAAGAAATTGGAAGAGGGGAAAACCCTCAATTTTATGGTATCTGACCTTGTCGACGTGGCTGAGGATGCCGTCGACATTTTCAAACAAAACGATGGGCATACTTGGAAGTATGATTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802113.1
MAEGLLLSVMHKLDMNYQKDTKTKEDIKEQMEMVIKEMREIVDIVRDKKLEEGKTLNFMVSDLVDVAEDAVDIFKQNDGHTWKYDSIHSWIGEMKERMLKLGDDGANINMRSSQNDEDDKYVVGLEEQMEMLLRTKIIGGEDYNRIVLIKGMSGIGKTTLAREIYNHPTIVERFKRRLWVSNVTHFTIKELLIKLIQQLEDPHTSSSLENMDNQSLRDMLRQHLLGTRYLIVLDDVPKQIRLKSFWEALPEEFNGSRLLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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