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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000806`

染色体: Chr03 坐标: 9218835-9226633 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000806`
名称	SmilChr03G000806
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	9218835 - 9226633 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017412`
GeneID	`131017412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017412`
原始查询	`LOC131017412`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=29.5; qcov=1.05; evalue=4.76e-78; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=28.1; qcov=0.926; evalue=2.28e-73; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057802146.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802146.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802146.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802146.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:9219280`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A9,B113,D5
`Chr3:9219280`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A9,B113,D5
`Chr3:9219339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B81
`Chr3:9219453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr3:9219480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B65,C19,C20,C6
`Chr3:9219549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C64,C66
`Chr3:9219633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr3:9219677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C14,C19,C34,C44,C66
`Chr3:9219759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B41,C10,C56,C74
`Chr3:9220134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B98,C4,C41
`Chr3:9220192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C41
`Chr3:9220305`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802146.1

852 aa

426

852

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 159-310 aa PF23559 WHD_DRP 394-460 aa PF23598 LRR_14 528-828 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802146.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	310	5.3e-31	108.2	NB-ARC domain
`XP_057802146.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	394	460	2.3e-08	34.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802146.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	528	828	1.2e-31	110.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946163.1
AGTTAACAAAGTTGAGATATGCAAGTTGGCTCCATTAATTAATTAGTCGGAGAAATATGGCGGAGGCAATGATATTATCGGCGGTGGAAAAGCTGGAGACTCTGCTGGTCAAGGAGGGCGCTTCCATCGTCGGCGGTGGGGAGCATGTGAGAGGTCTGCAAGATGATCTGAGAGGGATGCTGCCTCTCCTCACAGACGACAGCAGCACCAAGGAGCTGGCTCACGAGGCGGACCTCGCCATTGACACCTTCATCTCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017412
ATGGCGGAGGCAATGATATTATCGGCGGTGGAAAAGCTGGAGACTCTGCTGGTCAAGGAGGGCGCTTCCATCGTCGGCGGTGGGGAGCATGTGAGAGGTCTGCAAGATGATCTGAGAGGGATGCTGCCTCTCCTCACAGACGACAGCAGCACCAAGGAGCTGGCTCACGAGGCGGACCTCGCCATTGACACCTTCATCTCCAGCCGCGAGGATAAGAGAATTCGTCCTCGCAGATCTCGGATCGAATTCCTCACGAGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802146.1
MAEAMILSAVEKLETLLVKEGASIVGGGEHVRGLQDDLRGMLPLLTDDSSTKELAHEADLAIDTFISSREDKRIRPRRSRIEFLTRIDGIRSSLRNLKNDSRSSSPAEAAMRSSGLQPPPRRNILESQVVGMKEDVESLLQEAIFFDEAAAARWLSASCIVGMGGVGKTTLAQILYNHERVASEFELRAWVCVSSESLSAEEVLKELILQLGIEYDQPETKMVEADDRRRLRDMVFLHLRSRRYFIVLDHVWRDGDLEFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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