当前解析结果
SmilChr01G000164| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000164 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000164 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000164 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 2731152 - 2731907 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017442 |
|---|---|
| GeneID | 131017442 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017442 |
| 原始查询 | LOC131017442 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017442 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057802431.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057802431.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057802431.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057802431.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802431.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:2731181 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B20 |
Chr1:2731181 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B20 |
Chr1:2731182 |
TAC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 43 | A19,A20,B11,B113,B114,B117,B12,B138,B14,B17,B21,B22,B26,B29,B45,B51,B55,B59,B64,B73,B76,B79,B8,B84,B86,B9,B90,B94,C29,C31,C32,C55,C57,C58,C59,C7,C70,C8,C9,D1,D2,D3,D9 |
Chr1:2731196 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B64 |
Chr1:2731196 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr1:2731198 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B64 |
Chr1:2731198 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr1:2731386 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A22,A6,B23,B46,B52,B55,B65 |
Chr1:2731390 |
CGA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A22,A6,B23,B46,B52,B55,B65 |
Chr1:2731400 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,B91 |
Chr1:2731406 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,C11 |
Chr1:2731409 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,C13,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。