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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001181`

染色体: Chr03 坐标: 13557593-13560531 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001181`
名称	SmilChr03G001181
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13557593 - 13560531 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017497`
GeneID	`131017497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017497`
原始查询	`LOC131017497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26; qcov=0.984; evalue=6.16e-62; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.2; qcov=0.91; evalue=2.01e-66; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802235.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802235.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802235.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802235.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13557667`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B64,C24
`Chr3:13557667`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B64,C24
`Chr3:13557668`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	B101,B103,B11,B117,B124,B13,B136,B15,B3,B30,B33,B34,B47,B56,B57,B7,B72,B73,B81,B96,B99,C1,C19,C22,C26,C30,C31,C44,C49,C5,C55,C63,C69,C72,C75,C86,C87,D10
`Chr3:13557787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:13557812`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B136,B50,B73,B89,C49,C58,C71,D8
`Chr3:13557872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C9
`Chr3:13557873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:13557885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B46,C60,D11
`Chr3:13557901`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C55
`Chr3:13557901`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C55
`Chr3:13557904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,C31,C34,C63,C67
`Chr3:13557915`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A9,B114,B119,B135,B23,B46,B50,B6,B77,B89,C30,C49,C58,C60,C69,C71,D11,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802235.1

902 aa

451

902

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 173-345 aa PF23559 WHD_DRP 431-517 aa PF23598 LRR_14 657-870 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802235.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	173	345	3.8e-40	138.0	NB-ARC domain
`XP_057802235.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	431	517	1.4e-13	51.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802235.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	657	870	6e-17	62.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946252.1
CTTTCCATTTCCATCCACTCATCCTTCCAATCCTATATATCTGCATTTGCATTCTCTGCAAAAAAAAAAAAATGGTGGCTTATGCAGCTGTGGTTTCTCTTATGCAAACCATCCATCTGATCGAGCATCATCCATTCCCTCCAATTTCCATGGACAAACAACAAGTTGAATCTCTTACTGAAACTGTTATGCTCTTGCAGGAATTTCTTGAAGGTTACAAGTCCCCTGTTGCCGACGGCGATGAGGCCGATCAGTTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017497
ATGGTGGCTTATGCAGCTGTGGTTTCTCTTATGCAAACCATCCATCTGATCGAGCATCATCCATTCCCTCCAATTTCCATGGACAAACAACAAGTTGAATCTCTTACTGAAACTGTTATGCTCTTGCAGGAATTTCTTGAAGGTTACAAGTCCCCTGTTGCCGACGGCGATGAGGCCGATCAGTTGGAGATGCACATCGCAGATGCAGCTCATGAGGCTGAAGATGCTATCGAATCTCATATCGCCGATCAAATTCTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802235.1
MVAYAAVVSLMQTIHLIEHHPFPPISMDKQQVESLTETVMLLQEFLEGYKSPVADGDEADQLEMHIADAAHEAEDAIESHIADQILPAVSRNRIGLFNCFRGLKKPQIDAPKITSADLYDSLRKVIQDMDVIKKQVTQIVADKAAVRSQLQRQISTSTSSLSRTNSTMMGSDDVMHQLMDKLTNRDPHRQVIPIVGMGGIGKTTLARNVYARFTNMHFDICAWVAISQHYDIKKLLCDILSQASNEWGSEKGRERLSRMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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