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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000490`

染色体: Chr01 坐标: 9959422-9961968 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000490`
名称	SmilChr01G000490
描述	uncharacterized SmilChr01G000490
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9959422 - 9961968 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017520`
GeneID	`131017520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017520`
原始查询	`LOC131017520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0125300` - identity=33.1; qcov=0.185; evalue=1.26e-16; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13976 (gag_pre-integrs); PF14223 (Retrotran_gag_2); PF22936 (Pol_BBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802314.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802314.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802314.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802314.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9959430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:9959431`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A18,A3,A7,B103,B107,B12,B128,B13,B132,B135,B136,B140,B2,B24,B25,B27,B37,B38,B39,B40,B51,B55,B73,B76,B77,B78,B98,B99,C1,C15,C18,C19,C2,C30,C31,C37,C4,C44,C53,C55,C57,C6,C61,C62,C75,C8,D11,D4,D9
`Chr1:9959476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B26,C8
`Chr1:9959481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A15,A2,B105,B11,B112,B12,B16,B27,B47,B50,B59,B64,B68,B69,B78,C10,C2,C35,C39,C50,C53,C56,C60,C62,C63,C65,C67,C81,C82,C85
`Chr1:9959488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A16,A22,A8,B112,B131,B31,B57,B77,B90,D3
`Chr1:9959516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B54,B92,C1,D11
`Chr1:9959538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A13,A9,B111,B121,B122,B123,B129,B137,B139,B18,B28,B31,B37,B5,B54,B59,B6,B60,B63,B65,B72,B85,B88,B89,C20,C27,C31,C33,C41,C46,C49,C5,C50,C56,C67,C75,C84,C9,D8
`Chr1:9959549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C35
`Chr1:9959570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,D11
`Chr1:9959577`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A24,B12,B127,B2,B55,B85,C20,C38,C71,C83
`Chr1:9959580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B24,C28,C62,D10
`Chr1:9959598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,C79,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802314.1

848 aa

424

848

Retrotran_gag_2

Pol_BBD

gag_pre-integrs

PF14223 Retrotran_gag_2 63-216 aa PF22936 Pol_BBD 702-777 aa PF13976 gag_pre-integrs 811-847 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802314.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	63	216	6.5e-24	85.3	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057802314.1`	Pfam	`PF22936`	Pol_BBD	Domain	702	777	1.7e-16	61.0	Pol polyprotein, beta-barrel domain
`XP_057802314.1`	Pfam	`PF13976`	gag_pre-integrs	Domain	811	847	3.4e-10	40.3	GAG-pre-integrase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946331.1
ATGGATTTGTCAAGTGTGTCGGCTCGACCTCCTACTCTTGATAGTGGTGGGAAGAACTACAACTTGTGGAAAACTAGGATGAAAATTTATATCAAATCTATTGATGAACGTGCCTGGGTGGCTGTGTTGGATGGGTGGACCCCACCGCGTACCACTGATGAAAATGGAGTGACTTCTCTCACACCCGAGAGTAAATGGTCTGCTGATGAAAGACTTATTTCTAACCATAACTCCAGAGCCTTGAATGTTATCTTTATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017520
ATGGATTTGTCAAGTGTGTCGGCTCGACCTCCTACTCTTGATAGTGGTGGGAAGAACTACAACTTGTGGAAAACTAGGATGAAAATTTATATCAAATCTATTGATGAACGTGCCTGGGTGGCTGTGTTGGATGGGTGGACCCCACCGCGTACCACTGATGAAAATGGAGTGACTTCTCTCACACCCGAGAGTAAATGGTCTGCTGATGAAAGACTTATTTCTAACCATAACTCCAGAGCCTTGAATGTTATCTTTATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802314.1
MDLSSVSARPPTLDSGGKNYNLWKTRMKIYIKSIDERAWVAVLDGWTPPRTTDENGVTSLTPESKWSADERLISNHNSRALNVIFISVDVPAFRMISNCTEARDAWLILQEQCEGSASVRVTKMRMLTTKFEILRMHDDETISTYYEKLCEISNEAVGLGEPISNERLVSKLLRSLPERYNTKISSIEETADVANMRVGDLVSKLLTFEMNLEQQKAGHVSKSVAFRVEKIHENSEISNLSECTDVDPEEEDDVNLAMLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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