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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001136`

染色体: Chr03 坐标: 13087507-13089899 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001136`
名称	SmilChr03G001136
描述	uncharacterized SmilChr03G001136
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13087507 - 13089899 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017534`
GeneID	`131017534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017534`
原始查询	`LOC131017534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802303.1`
2	Nuclear body	核内小体	1.00000	`XP_057802303.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057802303.1`
4	PML body	PML body	0.80000	`XP_057802303.1`
5	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057802303.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13088185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:13088186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:13088717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:13088764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A14,B27,B58,B89
`Chr3:13088850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A14,B27,B89,C77
`Chr3:13088870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,D1
`Chr3:13088905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B16,C13,C74
`Chr3:13088905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C13,C74
`Chr3:13088938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B73
`Chr3:13088938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:13088945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:13088962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B29,C35,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802303.1

684 aa

342

684

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 533-673 aa

XP_057802304.1

680 aa

340

680

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 529-669 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802303.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	533	673	6.6e-06	26.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057802304.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	529	669	6.5e-06	26.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946321.1
CATGCCCCTGGAGCCCGATGCTGACGATCTGTCGAGTCACTACTTCATATCAGCGCTGACACCGGGCGAACTCTCGGTGAGCTTCAGGCCCCCCGACAACCCATTAGCTCGGGGTGTCCAATTTCCACAGGGCACCGGAGCCCGTGTTGTGGAGGAGCGCGGGGACGAGGAGGATGTACCTAGACAGCCTCGTACGACTCGCAGTCACAGTGTCCGGGGCCCTGTGAGGGATGCTCGACAGCACGAGCCGGCTCGTCATT...

XM_057946320.1
CATGCCCCTGGAGCCCGATGCTGACGATCTGTCGAGTCACTACTTCATATCAGCGCTGACACCGGGCGAACTCTCGGTGAGCTTCAGGCCCCCCGACAACCCATTAGCTCGGGGTGTCCAATTTCCACAGGGCACCGGAGCCCGTGTTGTGGAGGAGCGCGGGGACGAGGAGGATGTACCTAGACAGCCTCGTACGACTCGCAGTCACAGTGTCCGGGGCCCTGTGAGGGATGCTCGACAGCACGAGCCGGCTCGTCATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131017534
ATGCCCCTGGAGCCCGATGCTGACGATCTGTCGAGTCACTACTTCATATCAGCGCTGACACCGGGCGAACTCTCGGTGAGCTTCAGGCCCCCCGACAACCCATTAGCTCGGGGTGTCCAATTTCCACAGGGCACCGGAGCCCGTGTTGTGGAGGAGCGCGGGGACGAGGAGGATGTACCTAGACAGCCTCGTACGACTCGCAGTCACAGTGTCCGGGGCCCTGTGAGGGATGCTCGACAGCACGAGCCGGCTCGTCATTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802303.1
MPLEPDADDLSSHYFISALTPGELSVSFRPPDNPLARGVQFPQGTGARVVEERGDEEDVPRQPRTTRSHSVRGPVRDARQHEPARHSVDPGSRPVRDARPHEPARHSVDPGKRPAPHTSSSSSGSRTVSSPSEGEVDRKWVKKTIRQEIKKAFGKFVEKLKSKGKKDRCKKSKHFRVPDSPDDDDQRRSPDPPQPRSPPQRRSPPPSASGPDASEPARHSRSCDDDPRGEEPRHPETQDYDEQWRAMNQSVQGDYTPAEQ...

XP_057802304.1
MPLEPDADDLSSHYFISALTPGELSVSFRPPDNPLARGVQFPQGTGARVVEERGDEEDVPRQPRTTRSHSVRGPVRDARQHEPARHSVDPGSRPVRDARPHEPARHSVDPGKRPAPHTSSSSSGSRTVSSPSEGEVDRKWVKKTIRQEIKKAFGKFVEKLKSKGKKDRCKKSKHFRVPDSPDDDDQRRSPDPPQPRSPPQRRSPPPSASGPDASEPARHSRSCDDDPRGEEPRHPETQDYDEQWRAMNQSVQGDYTPAEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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