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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000973`

染色体: Chr03 坐标: 11023737-11029542 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000973`
名称	SmilChr03G000973
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	11023737 - 11029542 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017535`
GeneID	`131017535`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017535`
原始查询	`LOC131017535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 2
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28.2; qcov=1.03; evalue=1.65e-38; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=25; qcov=1.02; evalue=2.53e-39; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017535

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802305.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802305.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802305.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802305.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:11027778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:11027791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B119,B15,C28,C66
`Chr3:11027799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B15,C28,C66
`Chr3:11027800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B15,C28,C66
`Chr3:11027802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B15,C28,C66
`Chr3:11027804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:11027811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:11027813`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B1,B104,B119,B15,C28,C66
`Chr3:11027816`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B1,B104,B119,B15,C28,C66
`Chr3:11027832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B1,B104,B119,B15,C28,C66
`Chr3:11027864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C18,C2
`Chr3:11027864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802305.1

612 aa

306

612

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 2-80 aa PF23598 LRR_14 288-593 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802305.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	2	80	3.4e-09	37.2	NB-ARC domain
`XP_057802305.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	288	593	5.5e-33	114.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946322.1
TTCCATTGTAACAGAAGACTTTTGGAATCCTATTTCAGAAAAACGAAAGCAGAGAAGCTAAGGAAAATGGAGGATTGATTCGGAAAGTAGATCAAGTCGAGTAAGAAGAAGAATAGCGAAAAGTTAATTTGTTCCAAGCAGAAGTATGTCGGAGGCGCTCCTCTTATCGGTGATACAGAAGCTGGACATTAATTATGAAGAGGACACAGAAACAAATGAGGAAATGAGAAGGGTAATCAAAGAGGTGAGAGAGATTATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017535
ATGCTTTATGATCACTTGGAAGGAAGGCGATATTTTATAGTTCTCGACGACGTACCCAAACAAATGCGCTTGAAGTCTTTGTTGGATACTCTTCGAGAAGAATACAATGGAAGTAGATTGCTGCTCACAAGTCACACAATGCATGCCGACTTACATGTAGGCGATGAACATGTTCATCAGATGAAAGCTTTGGATTCTAAGAAGAGCTGGAAACTGTTTCTGAAAACAATAAACCATGGCAATAAATTGACGGGTGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802305.1
MLYDHLEGRRYFIVLDDVPKQMRLKSLLDTLREEYNGSRLLLTSHTMHADLHVGDEHVHQMKALDSKKSWKLFLKTINHGNKLTGDHKFPMKLEHMGKQMLRKCDGLPLAIKEVGKQLVEKKLSGRSEWEQLLESVDFGSTLKLLEPFYHQLDPKVQSCFLCMAFFKANTSLRAEKLKQIWVAGRVVDSTYKCESYLDGLINESVIEVKEKSTKYYMNGVLHMLSIQKAEEELGFEILRNSGNNRPSESPRHRVIICSRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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