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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001205`

染色体: Chr03 坐标: 13885675-13888972 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001205`
名称	SmilChr03G001205
描述	putative disease resistance protein At1g59780
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13885675 - 13888972 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017540`
GeneID	`131017540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017540`
原始查询	`LOC131017540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g59780
产物	putative disease resistance protein At1g59780
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=34.3; qcov=1.02; evalue=8.24e-76; confidence=low
Rice	`Os10g0358200` - identity=29.2; qcov=1.02; evalue=4.04e-42; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057802310.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802310.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802310.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802310.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13886296`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr3:13886296`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr3:13886320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B122,C60
`Chr3:13886325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B95,C1,C46
`Chr3:13886332`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	112	A10,A11,A14,A18,A20,A21,A23,A3,A5,A7,B1,B10,B101,B102,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B12,B124,B126,B128,B13,B130,B131,B134,B135,B137,B140,B15,B16,B19,B22,B23,B25,B26,B35,B36,B37,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B49,B5,B52,B53,B54,B55,B57,B6,B62,B65,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B78,B79,B80,B82,B84,B86,B88,B90,B91,B92,B98,C13,C14,C15,C17,C18,C20,C25,C26,C30,C31,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C43,C44,C46,C5,C50,C6,C64,C66,C7,C70,C72,C75,C76,C77,C86,D2,D3,D6,D8,D9
`Chr3:13886342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B68,B76,B79,B97,D6
`Chr3:13886382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B82,C86
`Chr3:13886394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B41
`Chr3:13886430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:13886436`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A20,A23,B18,B20,B46,B47,B48,B55,B74,B84,B93,B99,C12,C18,C2,C54,C61,C69,D4
`Chr3:13886440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B32,C28,C58
`Chr3:13886468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802310.1

571 aa

286

571

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 70-147 aa PF23598 LRR_14 204-538 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802310.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	70	147	5.4e-13	49.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802310.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	204	538	3.3e-28	99.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099647.1
CTCTACAACGAGAACAGCACCAGCTTTGATCTTTCCGCATGGGTTTGCATTAGTCAGCAATGTCAGAGTTTTCAATCAGTTTGGAATGATGTTCTCATGCAGCTACAGCATCAAAACACGAAGGATGGGCCAAAAATAAGGGACGATGTTACAAGTTTGAGCGAGTGGGAGTTGAAGGAGCGACTATGCAAGATACAAAAAGAGAAGCGATGCCTCATTGTTTTTGACGATCTTTGGGAAACTTCTTATTGGGATGGCTT...

XM_057946327.1
CTCTACAACGAGAACAGCACCAGCTTTGATCTTTCCGCATGGGTTTGCATTAGTCAGCAATGTCAGAGTTTTCAATCAGTTTGGAATGATGTTCTCATGCAGCTACAGCATCAAAACACGAAGGATGGGCCAAAAATAAGGGACGATGTTACAAGTTTGAGCGAGTGGGAGTTGAAGGAGCGACTATGCAAGATACAAAAAGAGAAGCGATGCCTCATTGTTTTTGACGATCTTTGGGAAACTTCTTATTGGGATGGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017540
ATGGTGCAAAAATGTGGGTATTTGCCGTTGGCAATTTCTTTACTTAGTGGGGTCTTGAGAATGAAAAATTCGATGAAGGAGTGGGAGTTAGTAAATGAGGATATCAAAGAATTCATATATAGAGGTGAAAGTGAGATTGATGGAGTGTTAAATTTAAGCTATGAAAGTCTACCCTATTATTTGAAGTCTTGCTTTCTCTATATGGGTATATTTCAAGAGGATGAAGATATAGATGTTGACGATCTATATCCGATGTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802310.1
MVQKCGYLPLAISLLSGVLRMKNSMKEWELVNEDIKEFIYRGESEIDGVLNLSYESLPYYLKSCFLYMGIFQEDEDIDVDDLYPMWIAQGMISYENIGDKDKTLYEIAELYLGELASRSIVQVEIYDGVTPRRKYETCKLHDVVRELCLKLGRSEDFGTQSLEYQSGKVSSHRKIRHLAIHFRKEVQVEPDELTLTWGEDSNEHLRSLQMFSHINSGVVEFPPQGIVDFHKFKLLRDLVMVGFKFEGRKLSKGIASLVHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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