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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001207`

染色体: Chr03 坐标: 13919951-13922319 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001207`
名称	SmilChr03G001207
描述	probable disease resistance protein At1g58390
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	13919951 - 13922319 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017545`
GeneID	`131017545`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017545`
原始查询	`LOC131017545`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58390
产物	probable disease resistance protein At1g58390
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=31.5; qcov=1.04; evalue=5.64e-54; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=28.9; qcov=1.04; evalue=3.44e-32; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017545

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802320.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802320.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057802320.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802320.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802320.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:13920378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B60,B65,B87,C31
`Chr3:13920396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C21,C36
`Chr3:13920425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C21,C22
`Chr3:13920484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr3:13920524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:13920528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A4,A6,B102,B110,B118,B119,B123,B128,B131,B16,B20,B32,B56,B78,B83,B84,B93,B95,B96,C19,C28,C33,C37,C38,C47,C5,C67,C70,C71,C76,D3,D7
`Chr3:13920529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A23,A6,A8,B137,B15,B18,B20,B23,B37,B41,B57,B69,B8,B83,B93,C18,C22,C23,C24,C28,C3,C32,C36,C40,C45,C52,C56,C71,C78,C82
`Chr3:13920549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:13920556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B18,C33
`Chr3:13920585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr3:13920594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:13920609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802320.1

500 aa

250

500

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 3-80 aa PF23598 LRR_14 140-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802320.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	80	1.5e-12	48.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057802320.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	140	472	2.7e-24	86.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946337.1
CATTATTAATGAGGATTTAGTATTTCTTTAGTTATGTGAAGTAGTGCGTTAGTGAATGAATCCAATTATTACTTTTATTTTCAGATATCAAGTTATTAATTATTATTAATAATCCTATATTTTGTTATGTAAGTTATTAGGACATATTTTGATTAATCTTAGTACCTCAAATTGAAAGAGATTTTTTTATTCCACATCGAAAGAGATTTATTTTAAATATTACAATGAAGTTTTTATATTATAATTTTAGAATACTAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017545
ATGGGTATATTTCAAGAGGACGAAACCATAAATCCTAAGGATCTATTTAGGATGTGGATAGCACAAGGGATGATTTCATATGAGAATATTGGAGACAAGGACAAAACTTTGATTGAAATCGCGAAGCTCTACCTGGGTGAGTTGGCCTCCAGATCCATCGTCCAAGTTGAAATTGACGATGCTGTCACACGTGGAATAATATATAGGAGCTGCGAACTTCATGATGTAGTAAGAGAACTATGTTTGAAATTGGGGAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802320.1
MGIFQEDETINPKDLFRMWIAQGMISYENIGDKDKTLIEIAKLYLGELASRSIVQVEIDDAVTRGIIYRSCELHDVVRELCLKLGRSEDFGVQCLEYQSGKLRQASSHRKIRHLTIHFRKEVQVKHDELTVTWGEDSSEHLRSLQMFNHINSGVVEFPPQSIIDFQKFKMLRDLVMVGFKFTGRKLPKGITNLVHLRRLYLKRCEFDKLPSSIRSLVYMDTLDLTDSMNVEVPNVFKEMVRLKHLFLPEYEEENIGSYRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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